More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0798 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  659    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  93.4 
 
 
318 aa  624  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  44.87 
 
 
317 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  41.4 
 
 
318 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.97 
 
 
315 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.63 
 
 
321 aa  259  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.85 
 
 
315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.78 
 
 
313 aa  248  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.19 
 
 
319 aa  248  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  42.02 
 
 
306 aa  247  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.24 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.81 
 
 
328 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  37.94 
 
 
324 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  40.58 
 
 
323 aa  239  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.19 
 
 
319 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.99 
 
 
320 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 
320 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
321 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  39.42 
 
 
323 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  39.12 
 
 
321 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.33 
 
 
338 aa  232  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.71 
 
 
309 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.61 
 
 
309 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.97 
 
 
324 aa  229  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.94 
 
 
322 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 
320 aa  228  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.29 
 
 
506 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.05 
 
 
341 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
332 aa  222  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3173  UDP-galactose 4-epimerase, putative  41.78 
 
 
309 aa  221  9e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.87 
 
 
508 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  37.74 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.37 
 
 
320 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  36.25 
 
 
318 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.34 
 
 
293 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  38.41 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.11 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  35.11 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.11 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.11 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.11 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.11 
 
 
321 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.11 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 
313 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
321 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 
318 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.18 
 
 
323 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
321 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
321 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 
314 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
320 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 
320 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
318 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  35.69 
 
 
309 aa  205  8e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2249  hypothetical protein  34.46 
 
 
307 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939616  hitchhiker  0.00832772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.15 
 
 
302 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.448502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
321 aa  178  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.9 
 
 
307 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  35.23 
 
 
320 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
307 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 
318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
305 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
307 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
311 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
285 aa  152  8e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  27.88 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.36 
 
 
313 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  27.53 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
298 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1954  NAD dependent epimerase/reductase-related protein  29.17 
 
 
339 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
310 aa  109  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0750302  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
321 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
333 aa  105  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
336 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
334 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
327 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131768  normal  0.0846691 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 
335 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
336 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
326 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 
326 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
331 aa  99  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
310 aa  99  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.66 
 
 
330 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.608202  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1237  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.66 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000110601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>