More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3176 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3176  ABC transporter related protein  100 
 
 		 218 aa  433  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1589  ABC transporter related protein  87.91 
 
 		 230 aa  355  3.9999999999999996e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11191  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1582  ABC transporter related protein  77.83 
 
 		 240 aa  327  6e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0852  ABC transporter related protein  76.89 
 
 		 240 aa  324  5e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21600  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.62 
 
 		 214 aa  222  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.36 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.31196  normal  0.583973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0083  ABC transporter related  48.77 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.599688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  47.32 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.83 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  44 
 
 		 242 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  43.81 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  43.81 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  50.25 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  45.1 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  45.1 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  44.06 
 
 		 234 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  44.19 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15650  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.66 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  44.55 
 
 		 237 aa  161  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  43.48 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  41.71 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.65 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.65 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.71 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.65 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.65 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.65 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  41.71 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  48.73 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.05 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  41.4 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  43.78 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.23 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.23 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  45.05 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  43.01 
 
 		 408 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.23 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  44.08 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.23 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  45.93 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  45.79 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  44.06 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  41.87 
 
 		 238 aa  158  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.31 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2963  ABC transporter related  45.41 
 
 		 251 aa  157  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  40.39 
 
 		 230 aa  157  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.16 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.23 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  40.48 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  47.69 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4330  ABC transporter related protein  47.69 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4104  ABC transporter related  35.48 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0242374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  45.23 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  44.1 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  40.19 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.23 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  38.89 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  38.36 
 
 		 246 aa  155  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  45.26 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  48.17 
 
 		 227 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 233 aa  155  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  40.3 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  41.12 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  39.69 
 
 		 231 aa  155  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  48.17 
 
 		 227 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  40.21 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  44 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.73 
 
 		 236 aa  155  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  43.5 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  45.32 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  39.34 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  43.07 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  45.81 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  44.39 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  49.19 
 
 		 305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  38.14 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.06 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  41.87 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  43.28 
 
 		 655 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04770  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.33 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  43.59 
 
 		 232 aa  154  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  43.65 
 
 		 249 aa  154  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.04 
 
 		 238 aa  154  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.52 
 
 		 227 aa  154  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  39.9 
 
 		 266 aa  154  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  43.81 
 
 		 227 aa  154  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  42.65 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  46.15 
 
 		 251 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  44.62 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.56 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>