68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2081 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
540 aa  1051    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  44.47 
 
 
554 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  34.42 
 
 
609 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  35.78 
 
 
516 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  37.62 
 
 
504 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  34.78 
 
 
527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  32.99 
 
 
634 aa  183  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  34.62 
 
 
519 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  33.71 
 
 
550 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  32.83 
 
 
501 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  33.01 
 
 
491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  30.81 
 
 
487 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  32.02 
 
 
511 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  30.04 
 
 
507 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  31.71 
 
 
486 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  31.45 
 
 
486 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  31.21 
 
 
554 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  30.71 
 
 
480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  31.08 
 
 
474 aa  133  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  31.34 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  28.22 
 
 
611 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  28.22 
 
 
508 aa  120  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  35.1 
 
 
658 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  31.16 
 
 
643 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  29.95 
 
 
488 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  31.82 
 
 
561 aa  102  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  22.27 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  21.37 
 
 
479 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  22 
 
 
480 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  21.37 
 
 
476 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  23.16 
 
 
486 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  22.58 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  25.23 
 
 
491 aa  76.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  22.32 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  27.09 
 
 
547 aa  74.3  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  27.02 
 
 
549 aa  73.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  21.86 
 
 
486 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  22.17 
 
 
470 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  25.12 
 
 
489 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  27.78 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  27.19 
 
 
530 aa  70.1  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  24.32 
 
 
467 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  26.14 
 
 
575 aa  67.4  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  25.91 
 
 
521 aa  67  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  25.29 
 
 
443 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  22.02 
 
 
493 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  28.9 
 
 
469 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  24.61 
 
 
480 aa  61.6  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  27.27 
 
 
646 aa  61.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  20.6 
 
 
513 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  25.52 
 
 
476 aa  60.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  25.54 
 
 
449 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  22.49 
 
 
472 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  22.43 
 
 
486 aa  59.3  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  22.36 
 
 
504 aa  57.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  21.19 
 
 
472 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  24.42 
 
 
494 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  23.68 
 
 
632 aa  54.7  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  39.13 
 
 
532 aa  54.3  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  22.75 
 
 
377 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  39.08 
 
 
555 aa  50.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  28.83 
 
 
579 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  25.85 
 
 
483 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  31.62 
 
 
558 aa  48.9  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  34.91 
 
 
555 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  36.54 
 
 
587 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  27.91 
 
 
171 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  22.89 
 
 
492 aa  45.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.472096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>