More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2752 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
180 aa  367  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  58.58 
 
 
176 aa  203  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  57.74 
 
 
170 aa  201  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  61.04 
 
 
160 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  59.74 
 
 
158 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  58.23 
 
 
159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  62.09 
 
 
156 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  59.74 
 
 
160 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  59.09 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  61.44 
 
 
156 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  59.21 
 
 
166 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  59.74 
 
 
157 aa  188  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  57.42 
 
 
166 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 
161 aa  184  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  60.67 
 
 
156 aa  184  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  60 
 
 
156 aa  184  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  60 
 
 
156 aa  184  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  59.21 
 
 
166 aa  183  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  56.21 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  59.87 
 
 
156 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  57.89 
 
 
166 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  57.89 
 
 
166 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  56.79 
 
 
166 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  58.67 
 
 
155 aa  174  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  58 
 
 
155 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 
157 aa  174  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  58.78 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  54.14 
 
 
164 aa  168  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 
158 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  52.98 
 
 
155 aa  166  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  48.41 
 
 
170 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
155 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
156 aa  127  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
155 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
155 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
155 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
157 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
155 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 
162 aa  124  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  38.71 
 
 
161 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  41.18 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  41.18 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  41.18 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  41.18 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
156 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  42 
 
 
152 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
202 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  40.51 
 
 
229 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 
157 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
157 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
202 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
159 aa  121  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 
161 aa  120  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
156 aa  120  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 
154 aa  120  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
153 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  38.92 
 
 
229 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
152 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
152 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
152 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  42.11 
 
 
152 aa  118  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
177 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
156 aa  117  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 
153 aa  117  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
154 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
181 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
157 aa  115  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
175 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
161 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
153 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
155 aa  114  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  37.25 
 
 
161 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
161 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
157 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
162 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
175 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  35.06 
 
 
175 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
162 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
156 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  37.58 
 
 
162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  40.79 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  40.79 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  39.62 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  35.8 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  40.79 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
167 aa  112  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>