53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4987 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  54.31 
 
 		 777 aa  716    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  53.29 
 
 		 3864 aa  679    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  59.44 
 
 		 764 aa  818    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  57.41 
 
 		 889 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  54.94 
 
 		 768 aa  723    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  55.7 
 
 		 770 aa  723    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  53.24 
 
 		 4830 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  83.07 
 
 		 790 aa  1259    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  100 
 
 		 763 aa  1531    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  49.81 
 
 		 768 aa  619  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  49.87 
 
 		 7434 aa  614  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  50 
 
 		 756 aa  610  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  49.39 
 
 		 781 aa  609  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  53.37 
 
 		 873 aa  612  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  48.62 
 
 		 1196 aa  598  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  53.14 
 
 		 860 aa  578  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  48.36 
 
 		 819 aa  570  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  64.9 
 
 		 465 aa  531  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  57.14 
 
 		 954 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  47.04 
 
 		 846 aa  411  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  50 
 
 		 918 aa  349  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  86.67 
 
 		 479 aa  349  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  49.11 
 
 		 3340 aa  278  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  49.23 
 
 		 4428 aa  278  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  50.91 
 
 		 1641 aa  260  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  46.82 
 
 		 2796 aa  249  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  74.48 
 
 		 145 aa  228  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.27 
 
 		 2156 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  34.58 
 
 		 3066 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  48.15 
 
 		 1099 aa  163  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  40.68 
 
 		 308 aa  138  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  32.49 
 
 		 1526 aa  132  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.44 
 
 		 2768 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  31.47 
 
 		 5442 aa  104  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  28.54 
 
 		 4697 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  30.87 
 
 		 1699 aa  75.1  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.02 
 
 		 2839 aa  70.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  27.58 
 
 		 2886 aa  65.1  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.94 
 
 		 2927 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.72 
 
 		 4480 aa  58.2  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  31.71 
 
 		 2193 aa  58.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1151 aa  56.2  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  29.68 
 
 		 1902 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  27.6 
 
 		 1359 aa  55.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  32.35 
 
 		 852 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  29.57 
 
 		 2194 aa  53.5  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.58 
 
 		 1590 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  25.93 
 
 		 1827 aa  47.8  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  28.98 
 
 		 3227 aa  47.8  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  27.33 
 
 		 3146 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  32.92 
 
 		 1092 aa  47.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  35.34 
 
 		 1627 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  28.29 
 
 		 746 aa  44.3  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>