85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4903 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4903  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
517 aa  1036    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  59.18 
 
 
578 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  35.07 
 
 
785 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  34.5 
 
 
785 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  32.84 
 
 
783 aa  274  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  32.84 
 
 
783 aa  274  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  35.42 
 
 
772 aa  250  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  35.42 
 
 
772 aa  250  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  32.1 
 
 
773 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  32.18 
 
 
786 aa  234  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  36.96 
 
 
769 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  34.44 
 
 
781 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3616  von Willebrand factor type A domain-containing protein  38.97 
 
 
562 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360736  normal  0.0799995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2754  cbbO protein  33.14 
 
 
778 aa  219  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.471735  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  29.28 
 
 
777 aa  219  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0872  von Willebrand factor type A  32.94 
 
 
773 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743934  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  34.92 
 
 
610 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1845  nitric oxide reductase activation protein-like  36.34 
 
 
519 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  31.98 
 
 
773 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4066  hypothetical protein  34.99 
 
 
743 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  34.46 
 
 
766 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  33.49 
 
 
781 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  36.18 
 
 
802 aa  203  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  28.88 
 
 
757 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2157  von Willebrand factor type A domain protein  33.01 
 
 
759 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1816  von Willebrand factor type A  33.01 
 
 
759 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627203  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  31.04 
 
 
756 aa  196  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  34.99 
 
 
749 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0910  von Willebrand factor type A  32.19 
 
 
788 aa  194  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  31.27 
 
 
773 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2839  von Willebrand factor, type A  32.91 
 
 
793 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3118  von Willebrand factor type A  31.9 
 
 
605 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2163  von Willebrand factor type A  33.53 
 
 
831 aa  158  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000626389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2535  von Willebrand factor type A domain protein  33.53 
 
 
805 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0652  von Willebrand factor type A  31.88 
 
 
852 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.380422  normal  0.150472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  30.35 
 
 
705 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  33.11 
 
 
614 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2163  von Willebrand factor type A  34.55 
 
 
842 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  31.63 
 
 
607 aa  141  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  32.68 
 
 
637 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  32.28 
 
 
913 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  27 
 
 
1006 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0602  von Willebrand factor type A  34.02 
 
 
532 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  33.33 
 
 
644 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0973  von Willebrand factor, type A  34 
 
 
624 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  35.86 
 
 
624 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  33.22 
 
 
689 aa  127  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  32.48 
 
 
638 aa  126  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  33.22 
 
 
689 aa  126  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  35.17 
 
 
624 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  32.57 
 
 
677 aa  124  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  32.77 
 
 
647 aa  123  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  32.77 
 
 
612 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  31.53 
 
 
637 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  33.56 
 
 
612 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 
633 aa  120  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  33.22 
 
 
618 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  30.31 
 
 
650 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.04 
 
 
618 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  33.47 
 
 
631 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  33.22 
 
 
612 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  29.61 
 
 
633 aa  113  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  27.92 
 
 
647 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  29.61 
 
 
633 aa  113  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  30.98 
 
 
636 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  28.96 
 
 
645 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2457  von Willebrand factor, type A  31.21 
 
 
576 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  33.1 
 
 
564 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4197  von Willebrand factor, type A  31.01 
 
 
570 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3800  von Willebrand factor, type A  29.24 
 
 
570 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00674568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3727  von Willebrand factor, type A  29.24 
 
 
570 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0342794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3739  von Willebrand factor, type A  29.24 
 
 
570 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0825  nitric oxide reductase activase protein  31.29 
 
 
674 aa  96.7  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451529  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2575  von Willebrand factor, type A  32.01 
 
 
571 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319004  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2582  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 
571 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2537  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 
571 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0698478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4504  MorD  29.9 
 
 
510 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4417  MorD  29.9 
 
 
510 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4798  MorD  30.23 
 
 
510 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653276  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1773  von Willebrand factor, type A  27.7 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4974  MorD  29.29 
 
 
510 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228255  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0117  putative nitric oxide reductase activation protein  26.2 
 
 
552 aa  47.8  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.17 
 
 
678 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  28.42 
 
 
842 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  24.81 
 
 
638 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>