More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4247 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  83.22 
 
 		 149 aa  248  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  83.22 
 
 		 149 aa  248  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  81.88 
 
 		 149 aa  244  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2875  transcriptional regulator NrdR  79.19 
 
 		 149 aa  243  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.591342  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  77.18 
 
 		 149 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2908  transcriptional regulator NrdR  76.87 
 
 		 149 aa  235  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0801227  normal  0.0399759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  73.83 
 
 		 151 aa  226  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3101  ATP-cone domain protein  69.39 
 
 		 147 aa  212  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  64.19 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  65.75 
 
 		 155 aa  201  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 154 aa  197  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  63.09 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 154 aa  193  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 154 aa  193  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  60.54 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  62.84 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  59.18 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  59.86 
 
 		 154 aa  180  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1550  transcriptional regulator NrdR  60.14 
 
 		 170 aa  177  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  57.72 
 
 		 160 aa  174  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  59.06 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  56.25 
 
 		 148 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  54.29 
 
 		 149 aa  157  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 173 aa  155  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2166  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.13572  normal  0.0195727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0005  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 159 aa  154  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  52.86 
 
 		 149 aa  153  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1870  ATP-cone domain protein  47.65 
 
 		 175 aa  153  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0173764  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  52.86 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  51.03 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  47.59 
 
 		 170 aa  150  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  48.97 
 
 		 154 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  48.28 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  48.97 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  48.97 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  48.28 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  48.28 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2136  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826839  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  48.97 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1849  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  48.97 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1910  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.658817  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  52.14 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  52.14 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 		 176 aa  147  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0472  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 163 aa  147  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.687081  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  52.14 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  48.28 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0296  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 163 aa  147  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  48.28 
 
 		 175 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  48.97 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0901  transcriptional regulator NrdR  46.21 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  50 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2386  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  49.31 
 
 		 161 aa  145  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>