More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1681 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  616  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  55.6 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1665  DeoR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  38.74 
 
 		 260 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  36.05 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  35.62 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  35.62 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  35.55 
 
 		 256 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.8 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 251 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 251 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 266 aa  126  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.92 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  30.92 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  30.92 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  30.92 
 
 		 269 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  34.62 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  35.54 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4038  DeoR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.5 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  35.02 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3160  DeoR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.71 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  33.21 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.71 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.71 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.71 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.71 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 251 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 294 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 251 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  34.02 
 
 		 253 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  30.08 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  35.83 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  31.76 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  32.65 
 
 		 251 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.6 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  29.18 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  35.86 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 251 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  33.86 
 
 		 263 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 		 278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 		 278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.73 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  32.05 
 
 		 275 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.64 
 
 		 252 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.64 
 
 		 252 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.64 
 
 		 252 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 252 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1360  DeoR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 274 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.019749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  32.49 
 
 		 256 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.97 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  31.43 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2796  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  32.13 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.61 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.61 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.12 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 259 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.06 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>