238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2223 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  85.98 
 
 		 499 aa  833    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 		 502 aa  982    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  66.87 
 
 		 497 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  73.57 
 
 		 497 aa  685    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  60.76 
 
 		 497 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  56.22 
 
 		 504 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  54.29 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0071  hypothetical protein  50.64 
 
 		 505 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  37.78 
 
 		 496 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  37.78 
 
 		 496 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  37.78 
 
 		 496 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0608  hypothetical protein  40.73 
 
 		 487 aa  314  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00222662  normal  0.0295774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  37.97 
 
 		 494 aa  312  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  39.55 
 
 		 500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.91 
 
 		 493 aa  310  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  38.24 
 
 		 494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  36.29 
 
 		 490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  37.17 
 
 		 498 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  37.97 
 
 		 506 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  40.52 
 
 		 498 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  40.52 
 
 		 498 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.9 
 
 		 503 aa  296  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  35.92 
 
 		 499 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.6 
 
 		 514 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  36.53 
 
 		 499 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  34.06 
 
 		 515 aa  289  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.47 
 
 		 514 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.07 
 
 		 516 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  34.62 
 
 		 502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.14 
 
 		 519 aa  282  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.04 
 
 		 503 aa  281  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  37.55 
 
 		 496 aa  281  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  33.27 
 
 		 508 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.57 
 
 		 491 aa  277  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  35.08 
 
 		 508 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  34.67 
 
 		 508 aa  276  8e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  35.39 
 
 		 512 aa  275  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  34.66 
 
 		 506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  34.71 
 
 		 507 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.19 
 
 		 536 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  35.11 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3933  hypothetical protein  33.4 
 
 		 505 aa  270  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  34.41 
 
 		 508 aa  270  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36 
 
 		 508 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3387  TRAP-T family transporter fused small and large inner membrane subunits  36.85 
 
 		 658 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.933362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.15 
 
 		 536 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1871  hypothetical protein  34.33 
 
 		 509 aa  269  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3033  hypothetical protein  35.82 
 
 		 658 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  34.17 
 
 		 529 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  32.85 
 
 		 504 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.2 
 
 		 506 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.79 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  33 
 
 		 504 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  34.48 
 
 		 510 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.3 
 
 		 504 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.73 
 
 		 508 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.67 
 
 		 506 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  33.67 
 
 		 506 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  33.67 
 
 		 506 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  34.55 
 
 		 506 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  33.67 
 
 		 506 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  33.67 
 
 		 506 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1563  hypothetical protein  37.53 
 
 		 529 aa  262  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.526146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3049  hypothetical protein  34.56 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  33.87 
 
 		 504 aa  262  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  33 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  32.65 
 
 		 519 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  34.16 
 
 		 506 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  32.87 
 
 		 504 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.68 
 
 		 504 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1960  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.29 
 
 		 509 aa  260  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0173399  normal  0.831984 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  32.87 
 
 		 509 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1714  hypothetical protein  34.52 
 
 		 500 aa  259  8e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.007229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  32.92 
 
 		 504 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  34.14 
 
 		 499 aa  259  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  32.33 
 
 		 504 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  33.05 
 
 		 505 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  32.84 
 
 		 505 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  35.19 
 
 		 504 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  33.06 
 
 		 505 aa  256  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  32.31 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  32.46 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  32.46 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1768  hypothetical protein  36.14 
 
 		 503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.567272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  33.26 
 
 		 500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  32.65 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  32.32 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  33.33 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  32.32 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.75 
 
 		 497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  32.32 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  33.81 
 
 		 510 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.61 
 
 		 502 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  31.7 
 
 		 500 aa  253  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  33.33 
 
 		 500 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.24 
 
 		 500 aa  253  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.45 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  32.31 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.05 
 
 		 505 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  32.84 
 
 		 503 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>