More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1309 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1309  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  660    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.47 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3897  hypothetical protein  38.23 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0101322  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.38 
 
 		 353 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  38.46 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3049  hypothetical protein  39.87 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  35.51 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.5 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  38.71 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  42.12 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  39.13 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3512  hypothetical protein  38.96 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543672  normal  0.304228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  40.25 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  38.41 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.12 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.08 
 
 		 332 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.56 
 
 		 328 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.69 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.48 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  38.14 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.38 
 
 		 325 aa  206  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  40.62 
 
 		 327 aa  205  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  36.42 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  40.27 
 
 		 339 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.22 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.85 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  38.65 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.85 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  38.39 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  38.87 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2519  hypothetical protein  40.13 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38.51 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  36.47 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  37.03 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  36.11 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.29 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  36.89 
 
 		 331 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  37.42 
 
 		 337 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  40.69 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  39.62 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.42 
 
 		 327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  38.61 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  38.1 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5386  hypothetical protein  38.72 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  36.99 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  38.27 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  36.92 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  39.46 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  37.38 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  36.86 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  35.61 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  39.29 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  35.86 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.46 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.39 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.62 
 
 		 328 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  37.69 
 
 		 335 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  37.01 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  37.37 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  37.61 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.14 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.01 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  36.62 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  37.42 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  41.08 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  35.18 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.29 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1653  hypothetical protein  39.69 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.386513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  37.58 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3811  extra-cytoplasmic solute receptor  37.37 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5452  hypothetical protein  35.9 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.67 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  34.86 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  38.05 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  34.15 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  37.95 
 
 		 329 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  38.28 
 
 		 329 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.36 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.47 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  36.67 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  38.25 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  35.29 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.6 
 
 		 326 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  37.12 
 
 		 326 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  37.79 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.22 
 
 		 327 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  36.01 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  38.05 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  37.3 
 
 		 343 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.25 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  36.88 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6352  hypothetical protein  37.58 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.997284  normal  0.0840681 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  36.39 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  35.8 
 
 		 698 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  38.8 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  38.75 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0421  hypothetical protein  38.8 
 
 		 337 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>