More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0421 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0421  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  661    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  44.22 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.61 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.83 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  39.73 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.43 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  44.44 
 
 		 325 aa  231  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.63 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.96 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  42.62 
 
 		 326 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.44 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.28 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.73 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.12 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.84 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.28 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  39.63 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.28 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  225  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.07 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.13 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.25 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.74 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.6 
 
 		 331 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  41.81 
 
 		 332 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.96 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.6 
 
 		 332 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.54 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.42 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.93 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  38.07 
 
 		 336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  38.64 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.82 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  39.02 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  43.05 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.64 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.48 
 
 		 327 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3049  hypothetical protein  41.45 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  38.41 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.29 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  39.07 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  38.36 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.07 
 
 		 322 aa  215  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  42.86 
 
 		 330 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.48 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  38.98 
 
 		 336 aa  215  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3897  hypothetical protein  40.88 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0101322  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.84 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.69 
 
 		 326 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  39.46 
 
 		 329 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  40.92 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  41.75 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.44 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  38.49 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  39.26 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  38.04 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  39.94 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  40.6 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.56 
 
 		 323 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  40.34 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  39.66 
 
 		 336 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  42.91 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  38.72 
 
 		 327 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  39.06 
 
 		 328 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  38.83 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.83 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.67 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.57 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.75 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  38.31 
 
 		 329 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.27 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.85 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.83 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  37.71 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  36.39 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  42.47 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.78 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  42.12 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.09 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  40.72 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.06 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  39.06 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.06 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.12 
 
 		 344 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  38.91 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.06 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.88 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  37.69 
 
 		 331 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37.71 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.49 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.31 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.93 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  40.33 
 
 		 329 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3512  hypothetical protein  37.84 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543672  normal  0.304228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.95 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.32 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  39.8 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>