147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2047 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2047  membrane protein  100 
 
 
485 aa  991    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512976  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02389  hypothetical protein  32.74 
 
 
480 aa  216  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003395  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.88 
 
 
481 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0958  MutT/nudix family protein  31.67 
 
 
465 aa  194  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  50 
 
 
140 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  43.86 
 
 
167 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01737  MutT/nudix family protein  30.69 
 
 
144 aa  53.5  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
140 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1561  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
149 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2181  PAP2 family protein  29.53 
 
 
346 aa  51.6  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  39.68 
 
 
129 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  55.32 
 
 
148 aa  52  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
140 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
130 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  39.68 
 
 
131 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  39.68 
 
 
131 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
209 aa  51.2  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
136 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  35.14 
 
 
132 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  44.44 
 
 
212 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
160 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
159 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
193 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  39.34 
 
 
131 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  42.86 
 
 
144 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  35.06 
 
 
132 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  41.46 
 
 
118 aa  49.3  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 
222 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
155 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  31.03 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  35.62 
 
 
131 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  31.03 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 
131 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
158 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
194 aa  48.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
140 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
140 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  30.71 
 
 
131 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  41.38 
 
 
159 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  41.38 
 
 
159 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
151 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
151 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  40 
 
 
141 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  40 
 
 
141 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
141 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
141 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.73 
 
 
128 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.73 
 
 
128 aa  47.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.73 
 
 
128 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
141 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
282 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  35.96 
 
 
147 aa  47  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
205 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
132 aa  47  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  40 
 
 
154 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  40 
 
 
154 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
228 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
153 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  52.08 
 
 
142 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
170 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2034  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.71 
 
 
338 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.349429  normal  0.0441147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
140 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
218 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
205 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  43.48 
 
 
524 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  46.15 
 
 
220 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  56.1 
 
 
156 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
149 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  42.62 
 
 
158 aa  45.8  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  40 
 
 
146 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
148 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
221 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2549  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 
145 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.925567  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2704  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
158 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0109153 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
127 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  42.11 
 
 
147 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  38.98 
 
 
147 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 
154 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  38.98 
 
 
147 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
153 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  39.71 
 
 
145 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  40.74 
 
 
154 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  34.52 
 
 
160 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
142 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  38.98 
 
 
147 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  55.88 
 
 
132 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
153 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2328  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.1 
 
 
173 aa  45.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.42836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
216 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.05 
 
 
244 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.59 
 
 
134 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  34.18 
 
 
178 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
142 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  40.74 
 
 
152 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  52.5 
 
 
132 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  40.98 
 
 
163 aa  44.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3302  MutT/Nudix family protein  36.51 
 
 
131 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.973400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  46.43 
 
 
185 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
187 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
157 aa  44.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>