26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003395 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003395  membrane-associated phospholipid phosphatase  100 
 
 
481 aa  972    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02389  hypothetical protein  70.68 
 
 
480 aa  703    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0958  MutT/nudix family protein  44.64 
 
 
465 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2047  membrane protein  31.98 
 
 
485 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512976  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01737  MutT/nudix family protein  40.24 
 
 
144 aa  57.4  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
143 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
140 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1561  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
149 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
142 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
140 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
175 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
141 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
216 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  43.64 
 
 
163 aa  44.3  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
211 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  45 
 
 
216 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  46 
 
 
147 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
141 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0169  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.65 
 
 
173 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
141 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
314 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 
301 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
195 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  45.65 
 
 
140 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  45.65 
 
 
140 aa  43.5  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
141 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>