More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1974 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  100 
 
 		 235 aa  486  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  43.75 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  43.56 
 
 		 303 aa  201  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  45.33 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  45.33 
 
 		 248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  44.44 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  44 
 
 		 304 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  42.41 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  44 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  40 
 
 		 298 aa  191  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.22 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  40.18 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  41.52 
 
 		 251 aa  185  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  41.2 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  40.91 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  40.79 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  40.28 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  41.07 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  41.07 
 
 		 246 aa  180  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  39.56 
 
 		 287 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.35 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  40.62 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  39.17 
 
 		 244 aa  178  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  38.84 
 
 		 266 aa  177  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  36.68 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  38.43 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  40.62 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  38.53 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  42.92 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  37.28 
 
 		 241 aa  167  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 249 aa  167  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  37.55 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  39.22 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 		 254 aa  161  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  38.83 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  36.4 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  38.2 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  36.6 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  37.39 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  38.29 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  37.89 
 
 		 266 aa  155  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  38.22 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  35.11 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  35.75 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  38.33 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0222  ABC transporter related  39.02 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  35.47 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  34.06 
 
 		 280 aa  150  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  37.95 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  35.09 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  35.96 
 
 		 268 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  34.36 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3370  ABC transporter-related protein  35.09 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  37.33 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  35.53 
 
 		 271 aa  148  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  34.25 
 
 		 258 aa  148  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  33.04 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.11 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  34.93 
 
 		 236 aa  148  9e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  35.29 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  33.33 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  36.2 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  35.22 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  39.9 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 		 280 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  35.32 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  34.62 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  35.22 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  34.78 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 		 259 aa  144  8.000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  33.91 
 
 		 249 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  35.19 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  32.88 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  34.05 
 
 		 298 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  32.63 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  34.18 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  33.48 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  35.02 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  34.33 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  34.33 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.33 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  34.98 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  34.35 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  32.47 
 
 		 289 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  35.81 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  30.57 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>