54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07118 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  411  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  46.39 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  46.35 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  45.83 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  48.35 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  43 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  45.08 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  46.11 
 
 		 206 aa  160  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  42.08 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  45.56 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  43.68 
 
 		 212 aa  157  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  43.96 
 
 		 280 aa  151  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  42.79 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  43.57 
 
 		 356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  37.93 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  43.48 
 
 		 128 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  33.89 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  43.36 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  34.91 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  38.2 
 
 		 405 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  32.5 
 
 		 334 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  32.94 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  30.28 
 
 		 339 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 462 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  34.26 
 
 		 341 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  35.23 
 
 		 463 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  28.32 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  32.43 
 
 		 315 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  29.17 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2828  hypothetical protein  29.27 
 
 		 557 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.899686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  35.11 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  33.65 
 
 		 497 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  26.32 
 
 		 266 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  30.56 
 
 		 257 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  30.84 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  31.46 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  33.96 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  32.14 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  29.03 
 
 		 266 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  28.41 
 
 		 99 aa  45.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  35.11 
 
 		 296 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  27.27 
 
 		 117 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  29.46 
 
 		 479 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  26 
 
 		 117 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  30.09 
 
 		 877 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  27.96 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  29.59 
 
 		 100 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  27.96 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  32.58 
 
 		 306 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  27.96 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  30.43 
 
 		 111 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  36.05 
 
 		 132 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  41.2  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>