More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05914 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  84.6 
 
 
578 aa  1041    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  100 
 
 
585 aa  1221    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  62.74 
 
 
580 aa  752    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  46.95 
 
 
579 aa  523  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  43.57 
 
 
583 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  43.04 
 
 
583 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  42.88 
 
 
578 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  42.68 
 
 
583 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  42.47 
 
 
592 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  42.43 
 
 
580 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  42.68 
 
 
583 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.36 
 
 
581 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.19 
 
 
581 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  42.01 
 
 
581 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  43.48 
 
 
573 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  40.99 
 
 
577 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.56 
 
 
581 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  41.92 
 
 
581 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  42.38 
 
 
586 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  40 
 
 
580 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  30.23 
 
 
664 aa  251  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  30.94 
 
 
591 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  30.41 
 
 
607 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  31.19 
 
 
581 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.5 
 
 
558 aa  216  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.93 
 
 
533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  30.18 
 
 
584 aa  211  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.21 
 
 
627 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.12 
 
 
601 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  28.31 
 
 
663 aa  207  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.52 
 
 
523 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  26.71 
 
 
526 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.67 
 
 
555 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  28.33 
 
 
523 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  29.03 
 
 
625 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  27.92 
 
 
529 aa  198  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  28.64 
 
 
637 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  28.64 
 
 
637 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.63 
 
 
520 aa  184  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  26.13 
 
 
657 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.15 
 
 
672 aa  181  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.21 
 
 
659 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  25.94 
 
 
638 aa  179  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.35 
 
 
605 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  26.53 
 
 
641 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  27.93 
 
 
532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.71 
 
 
607 aa  174  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  27.84 
 
 
663 aa  167  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.83 
 
 
587 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  25.45 
 
 
504 aa  147  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  25.78 
 
 
619 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 
582 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.69 
 
 
508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.57 
 
 
518 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.19 
 
 
517 aa  123  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  25.39 
 
 
518 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.57 
 
 
515 aa  120  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  25.39 
 
 
518 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  25.39 
 
 
518 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  24.77 
 
 
523 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  24.59 
 
 
520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.59 
 
 
523 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  24.59 
 
 
520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.04 
 
 
518 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  29.03 
 
 
313 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  23.4 
 
 
530 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.22 
 
 
509 aa  106  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.18 
 
 
517 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.11 
 
 
516 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  23.54 
 
 
520 aa  104  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.47 
 
 
549 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.19 
 
 
503 aa  101  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.31 
 
 
539 aa  101  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  27.96 
 
 
302 aa  100  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.76 
 
 
1202 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.76 
 
 
1215 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.09 
 
 
549 aa  98.6  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  22.18 
 
 
523 aa  98.6  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  24.2 
 
 
515 aa  97.8  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  23.69 
 
 
508 aa  97.8  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  28.38 
 
 
315 aa  97.8  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  26.65 
 
 
577 aa  95.9  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.06 
 
 
1181 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.45 
 
 
1284 aa  92.8  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  28.48 
 
 
481 aa  90.9  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  24.61 
 
 
489 aa  90.5  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.72 
 
 
508 aa  90.1  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.72 
 
 
508 aa  90.1  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  26.81 
 
 
313 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.55 
 
 
1175 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  31.67 
 
 
574 aa  87  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  28.92 
 
 
565 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01256  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.05 
 
 
553 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3473  metallophosphoesterase  24.75 
 
 
303 aa  84  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.590454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  23.98 
 
 
613 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1474  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.68 
 
 
491 aa  82.8  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  26.55 
 
 
482 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1751  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.15 
 
 
553 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000978587  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.34 
 
 
479 aa  83.2  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0800  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.46 
 
 
553 aa  82.8  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>