More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000864 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000864  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter ATPase component  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06839  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  86.9 
 
 		 250 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0487  ABC transporter, ATP binding protein  61.66 
 
 		 257 aa  315  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2377  ABC transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 		 262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0907  ABC transporter related  46.78 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.379648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3268  ABC transporter related  45.64 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.110762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3657  ABC transporter related  46.93 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1932  ABC transporter related  48.05 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185012  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0927  ABC transporter related  44.26 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0131679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3123  ABC transporter-related protein  45.81 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1644  ABC transporter component  49.55 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0348832  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0034  ABC transporter related  47.32 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  37.11 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27180  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  37.89 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.785325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 275 aa  151  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  40.83 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0645  ABC transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1644  ABC transporter related protein  37.25 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  41.15 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  40 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  39.74 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  37.79 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2298  ABC transporter related  46.39 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.076659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  39.83 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.42 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  39.62 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  38.89 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  38.5 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0587  ABC transporter related  46.33 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.695126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  37.55 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  42.59 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  36.6 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  40.49 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  43.93 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 265 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  38.46 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1745  putative ABC transporter, ATP-binding protein  34.91 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00365459  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  39.45 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  38.72 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  39.45 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  33.33 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  43.46 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  43.46 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  38.91 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  37.2 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  38.17 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  33.47 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  41.46 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  39.44 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  39.65 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  38.22 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  36.69 
 
 		 272 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0393  ABC transporter related  43.88 
 
 		 281 aa  139  6e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  41.25 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  39.35 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  40.62 
 
 		 236 aa  139  6e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 284 aa  138  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 		 288 aa  138  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  40 
 
 		 270 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10000  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  42.93 
 
 		 241 aa  138  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0152878  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  33.33 
 
 		 272 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  39.68 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  39.68 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  37.89 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  37.5 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  34.24 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  37.96 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  38.39 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  33.33 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  40.42 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  38.89 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  42.06 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  36.65 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  42.71 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  41.9 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  36.56 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.83 
 
 		 324 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  38.5 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  40.27 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  41.03 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  37.75 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2557  ABC transporter related  40.47 
 
 		 362 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000431635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  39.37 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>