More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2298 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2298  ABC transporter related  100 
 
 		 226 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.076659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0645  ABC transporter, ATPase subunit  97.79 
 
 		 226 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0587  ABC transporter related  81.42 
 
 		 226 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.695126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0907  ABC transporter related  54.63 
 
 		 242 aa  194  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.379648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3657  ABC transporter related  49.78 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0034  ABC transporter related  51.29 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0927  ABC transporter related  53.93 
 
 		 251 aa  170  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0131679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1932  ABC transporter related  48.83 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185012  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0487  ABC transporter, ATP binding protein  42.79 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3268  ABC transporter related  50.98 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.110762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2377  ABC transporter ATP-binding protein  40.69 
 
 		 262 aa  151  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000864  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter ATPase component  46.43 
 
 		 252 aa  147  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06839  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.81 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1644  ABC transporter component  50.67 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0348832  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  49.48 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3123  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  45.05 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  41.33 
 
 		 352 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  47.5 
 
 		 357 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  42.2 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.33 
 
 		 363 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  47.51 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  38.89 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  43.64 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7802  ABC transporter ATP-binding protein  46.23 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2873  ABC transporter related  46.11 
 
 		 353 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204327 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  37.74 
 
 		 356 aa  125  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.38 
 
 		 402 aa  124  9e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.81 
 
 		 373 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  41.15 
 
 		 366 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  46.73 
 
 		 247 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  46.34 
 
 		 359 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  41.71 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1481  ABC transporter related  39.44 
 
 		 379 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00851578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  39.9 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.18 
 
 		 352 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4528  ABC transporter related  48.34 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4194  ABC transporter related  44.64 
 
 		 361 aa  121  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.812216  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1735  ATP-binding component of transport system for maltose  36.94 
 
 		 376 aa  121  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  40.28 
 
 		 299 aa  121  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  42.01 
 
 		 317 aa  121  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.63 
 
 		 253 aa  121  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  41.35 
 
 		 379 aa  121  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  45.1 
 
 		 267 aa  121  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  38.25 
 
 		 369 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0465  ABC transporter related  44.71 
 
 		 385 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.365708  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  43.18 
 
 		 268 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4565  ABC transporter related  44.44 
 
 		 361 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0315  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  38.59 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.599525  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4881  ABC transporter related  41.03 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3284  ABC transporter related  41.03 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.875863 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  43.32 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6379  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.92 
 
 		 360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2619  ABC transporter related  40.48 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53368  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  39.45 
 
 		 359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  40.09 
 
 		 349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  40.09 
 
 		 349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  45.05 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  41.55 
 
 		 360 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  38.99 
 
 		 375 aa  119  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  46.04 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.31 
 
 		 371 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.23 
 
 		 402 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6323  ABC transporter related  40.51 
 
 		 384 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.13 
 
 		 352 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1389  ABC transporter related  37.38 
 
 		 368 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6023  ABC transporter related  40.51 
 
 		 384 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.963161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  44.08 
 
 		 356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0328  ABC transporter related  42.72 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  46.46 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0478  ABC transporter related  43.89 
 
 		 333 aa  118  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  41.62 
 
 		 301 aa  118  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.59 
 
 		 345 aa  118  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  39.81 
 
 		 350 aa  118  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.31 
 
 		 371 aa  118  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.65 
 
 		 255 aa  118  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  39.71 
 
 		 272 aa  118  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  39.91 
 
 		 349 aa  118  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  39.65 
 
 		 349 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 		 329 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  41.31 
 
 		 341 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4584  ABC transporter related  40.2 
 
 		 384 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.4 
 
 		 399 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.44 
 
 		 382 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.5 
 
 		 388 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3781  ABC transporter related  48.88 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6161  ABC transporter related  43.19 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.551746 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.26 
 
 		 360 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  40.19 
 
 		 360 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  40.19 
 
 		 360 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  40.8 
 
 		 329 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0450  ABC transporter related  40.62 
 
 		 293 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505775  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.1 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.1 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  43.06 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  37.5 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  43.44 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  43.07 
 
 		 267 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>