More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1289 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1289  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 262 aa  541  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003820  peptide transport system ATP-binding protein SapF  82.63 
 
 		 263 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0778601  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01866  hypothetical protein  82.63 
 
 		 260 aa  454  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0475  peptide transport system ATP-binding protein SapF  81.25 
 
 		 255 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1888  ABC transporter related  61.72 
 
 		 271 aa  331  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.26331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1780  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  61.72 
 
 		 271 aa  331  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2544  peptide transport system ATP-binding protein  61.72 
 
 		 271 aa  331  8e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2633  ABC transporter-related protein  58.3 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1931  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  58.3 
 
 		 268 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00733076 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01267  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  58.3 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2356  ABC transporter related protein  58.3 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1404  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  58.3 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1832  peptide transport system, ATP-binding protein SapF  58.3 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865298  hitchhiker  0.0000646533 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2335  ABC transporter related  58.3 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1497  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  58.3 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01278  hypothetical protein  58.3 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1526  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  58.3 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.629898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2175  ABC transporter related  58.98 
 
 		 268 aa  319  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0158301 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1636  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  58.59 
 
 		 268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.55489  hitchhiker  0.00000000158294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1820  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  58.59 
 
 		 268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.90889e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1454  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  58.59 
 
 		 268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1825  peptide transport system ATP-binding protein SapF  58.59 
 
 		 268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186073  hitchhiker  0.003112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1882  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  58.59 
 
 		 268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  hitchhiker  0.000716142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2346  ABC transporter related  57.87 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2617  ABC transporter related protein  57.87 
 
 		 271 aa  308  4e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0151151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1714  ABC transporter related  56.69 
 
 		 271 aa  298  6e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1748  ABC transporter related  55.91 
 
 		 271 aa  295  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1548  ABC transporter related  53.97 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.73885  hitchhiker  0.000980474 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2502  ABC transporter-related protein  52.78 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2743  ABC transporter related  53.2 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.39241  normal  0.48715 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1634  ABC transporter related  53.2 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1611  ABC transporter related  53.63 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1600  ABC transporter related  53.2 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00484848  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2486  ABC transporter related  52.78 
 
 		 261 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1496  ABC transporter related  52 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2556  ABC transporter related  52.4 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595528  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2488  ABC transporter related  52.4 
 
 		 261 aa  278  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0320682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2654  ABC transporter related  52.4 
 
 		 261 aa  278  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.53593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1231  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.81 
 
 		 261 aa  278  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3106  ABC transporter related  53.6 
 
 		 262 aa  278  8e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231583  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1801  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2584  ABC transporter related  52.42 
 
 		 261 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2675  ABC transporter related  52.38 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14935  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3779  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 258 aa  258  9e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0590  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2196  ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3010  ABC transporter related  44.66 
 
 		 261 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2815  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717135  normal  0.0541918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0394  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.24 
 
 		 317 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  40.94 
 
 		 619 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 334 aa  211  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 334 aa  211  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  40.71 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.71 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.44 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  40.71 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 358 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 358 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 358 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1950  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.74 
 
 		 334 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.189819  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 329 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0398  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 348 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  40.7 
 
 		 366 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.55 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.31 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 		 629 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 		 623 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.29 
 
 		 612 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1292  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.67 
 
 		 352 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00715286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 		 623 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0224  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.68 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  41.29 
 
 		 612 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 		 623 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 		 623 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  41.29 
 
 		 623 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 		 623 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0486  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.22 
 
 		 329 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  40.62 
 
 		 370 aa  205  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.49 
 
 		 339 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.74 
 
 		 344 aa  205  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.29 
 
 		 338 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.29 
 
 		 338 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.29 
 
 		 338 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  38.43 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3036  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.67 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.74 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.28 
 
 		 322 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.34 
 
 		 338 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>