More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0318 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 
288 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  61.59 
 
 
283 aa  359  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  56.83 
 
 
282 aa  334  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  57.19 
 
 
285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  57.09 
 
 
282 aa  324  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  55.71 
 
 
287 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  49.64 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  49.45 
 
 
281 aa  271  9e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  43.82 
 
 
296 aa  258  5.0000000000000005e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.72 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  43.21 
 
 
291 aa  245  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.9 
 
 
294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  47.14 
 
 
292 aa  242  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  39.87 
 
 
312 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.28 
 
 
272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.55 
 
 
293 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.1 
 
 
280 aa  208  9e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.87 
 
 
285 aa  201  9e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.75 
 
 
283 aa  191  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.85 
 
 
283 aa  189  4e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  36.27 
 
 
283 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.48 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  37.64 
 
 
267 aa  177  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.61 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.61 
 
 
271 aa  165  9e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.1 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.08 
 
 
281 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  38.1 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  30.31 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  37.62 
 
 
292 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  36.49 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  38.21 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  35.38 
 
 
292 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  37.61 
 
 
292 aa  123  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  36.41 
 
 
292 aa  124  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  35.82 
 
 
265 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  35.45 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  35.38 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  33.96 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.91 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  35.07 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0680474 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.45 
 
 
295 aa  112  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.38 
 
 
329 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  35.98 
 
 
264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  34.78 
 
 
307 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  35.51 
 
 
301 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  35.51 
 
 
301 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.92 
 
 
310 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  31.92 
 
 
266 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  30.45 
 
 
336 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  30.45 
 
 
336 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  32.26 
 
 
298 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  30.45 
 
 
338 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  32.73 
 
 
301 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.68 
 
 
309 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  30.67 
 
 
317 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  29.89 
 
 
331 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  31.19 
 
 
301 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  30.08 
 
 
330 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  29.08 
 
 
307 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  30.08 
 
 
328 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.08 
 
 
328 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  30.08 
 
 
328 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  30.08 
 
 
328 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.86 
 
 
324 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.91 
 
 
305 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  34.11 
 
 
301 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  34.11 
 
 
301 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.94 
 
 
301 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  30.28 
 
 
299 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  29.28 
 
 
301 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  29.07 
 
 
301 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  29.07 
 
 
301 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.34 
 
 
299 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.34 
 
 
299 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.07 
 
 
301 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  29.07 
 
 
301 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.34 
 
 
299 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  28.96 
 
 
299 aa  99.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  29.02 
 
 
302 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  29.02 
 
 
302 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.96 
 
 
267 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.84 
 
 
300 aa  99  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.73 
 
 
314 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  32.71 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  34.15 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  32.71 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  28.9 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.53 
 
 
411 aa  97.8  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.71 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.64 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.43 
 
 
447 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  32.71 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  33.8 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.85 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  29.49 
 
 
301 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  30.42 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.18 
 
 
300 aa  96.3  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  30.45 
 
 
301 aa  96.3  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  29.41 
 
 
300 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>