More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0190 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 393 aa  806    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  65.88 
 
 		 525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  62.47 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  64 
 
 		 532 aa  484  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  61.27 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  61.76 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  62.5 
 
 		 509 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  62.63 
 
 		 511 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  61.83 
 
 		 517 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  58.78 
 
 		 515 aa  463  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  59.79 
 
 		 513 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  59.31 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  58.24 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  59.53 
 
 		 536 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  58.16 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  57.45 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  57.63 
 
 		 507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  57.45 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  58.68 
 
 		 509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  59.16 
 
 		 513 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  59.16 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  57.44 
 
 		 512 aa  448  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  56.99 
 
 		 507 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  58.31 
 
 		 541 aa  449  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  59.16 
 
 		 513 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  58.14 
 
 		 536 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  58.64 
 
 		 513 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  58.14 
 
 		 536 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  60.16 
 
 		 513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  57.91 
 
 		 512 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  57.74 
 
 		 514 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  58.72 
 
 		 541 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  56.43 
 
 		 513 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  57.81 
 
 		 513 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  56.84 
 
 		 556 aa  443  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  57.14 
 
 		 546 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  57.14 
 
 		 546 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  56.38 
 
 		 515 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  58.03 
 
 		 516 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  57.33 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  58.78 
 
 		 510 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  55.75 
 
 		 515 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  57.1 
 
 		 516 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  56.58 
 
 		 556 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  56.88 
 
 		 546 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  57.33 
 
 		 511 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  58.2 
 
 		 519 aa  436  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  58.4 
 
 		 531 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  55.85 
 
 		 510 aa  436  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  55.91 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  57.96 
 
 		 530 aa  435  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  55.75 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  56.17 
 
 		 511 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  58.16 
 
 		 516 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  57.96 
 
 		 524 aa  431  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  56.92 
 
 		 510 aa  434  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  56.88 
 
 		 536 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  56.81 
 
 		 512 aa  431  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  55.13 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  56.84 
 
 		 515 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  57.49 
 
 		 518 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  55.5 
 
 		 516 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  56.81 
 
 		 512 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  57.14 
 
 		 522 aa  428  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  55.76 
 
 		 515 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  55.22 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  55.76 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  55.84 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  55.75 
 
 		 512 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  56.25 
 
 		 512 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  56.02 
 
 		 515 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  56.32 
 
 		 519 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  56.12 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  56.66 
 
 		 517 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2298  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16398  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  57.03 
 
 		 524 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  54.33 
 
 		 518 aa  428  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  55.76 
 
 		 515 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  55.76 
 
 		 515 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  56.84 
 
 		 515 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  56.84 
 
 		 398 aa  428  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  57.22 
 
 		 568 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  55.53 
 
 		 516 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  57.1 
 
 		 519 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  56.5 
 
 		 516 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 511 aa  424  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  55.9 
 
 		 514 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  55.58 
 
 		 539 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1018  2-isopropylmalate synthase  55.5 
 
 		 514 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  54.45 
 
 		 499 aa  425  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  53.99 
 
 		 528 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  55.32 
 
 		 539 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  54.76 
 
 		 522 aa  424  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  53.59 
 
 		 515 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  54.81 
 
 		 520 aa  423  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  55.5 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>