More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0656 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  49.54 
 
 		 774 aa  739    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  44.72 
 
 		 780 aa  636    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  46.83 
 
 		 781 aa  692    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 768 aa  1539    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  97.14 
 
 		 768 aa  1501    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  42.05 
 
 		 807 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  39.53 
 
 		 804 aa  549  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  39.53 
 
 		 793 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  38 
 
 		 804 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  37.75 
 
 		 800 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  38.13 
 
 		 791 aa  499  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  36.66 
 
 		 801 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  36.63 
 
 		 839 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  34.88 
 
 		 804 aa  490  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  36.4 
 
 		 801 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  36.06 
 
 		 804 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  37.14 
 
 		 806 aa  477  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  35.14 
 
 		 820 aa  474  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  37.22 
 
 		 811 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  36.35 
 
 		 813 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 841 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  35.63 
 
 		 819 aa  458  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  34.69 
 
 		 841 aa  435  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  35.76 
 
 		 818 aa  432  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  34.45 
 
 		 816 aa  429  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  34.99 
 
 		 803 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  36.08 
 
 		 802 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  34.41 
 
 		 804 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  35.72 
 
 		 804 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  31.31 
 
 		 1215 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  32.54 
 
 		 1150 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  33.02 
 
 		 1149 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  32.09 
 
 		 1223 aa  372  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  32.43 
 
 		 1150 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  32.43 
 
 		 1150 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  30.77 
 
 		 1180 aa  359  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  30.48 
 
 		 1196 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  28.92 
 
 		 1168 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.61 
 
 		 1163 aa  335  1e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  29.89 
 
 		 1182 aa  334  4e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  29.77 
 
 		 1182 aa  332  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  30.3 
 
 		 1188 aa  332  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  29.85 
 
 		 1188 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  29.04 
 
 		 1158 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  30.09 
 
 		 1171 aa  325  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  29.4 
 
 		 1192 aa  325  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  28.62 
 
 		 1254 aa  324  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  29.39 
 
 		 1158 aa  323  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  29.61 
 
 		 1178 aa  323  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  28.93 
 
 		 1272 aa  323  8e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  30.7 
 
 		 1189 aa  323  8e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  29.47 
 
 		 1184 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  30.44 
 
 		 1191 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  28.57 
 
 		 1157 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.5 
 
 		 1132 aa  321  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  30.35 
 
 		 1191 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.11 
 
 		 1132 aa  319  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  30.24 
 
 		 1183 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  29.1 
 
 		 1250 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  28.28 
 
 		 1156 aa  318  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  29.3 
 
 		 1191 aa  318  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.99 
 
 		 1132 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.99 
 
 		 1132 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  28.81 
 
 		 1154 aa  317  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.87 
 
 		 1132 aa  317  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.99 
 
 		 1133 aa  317  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.99 
 
 		 1132 aa  317  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  28.72 
 
 		 1154 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  29.43 
 
 		 1132 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.99 
 
 		 1133 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  28.82 
 
 		 1232 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  29.23 
 
 		 1132 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  28.48 
 
 		 1187 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  29.83 
 
 		 1176 aa  315  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  29.98 
 
 		 1188 aa  313  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  29.69 
 
 		 1227 aa  313  7.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  29.58 
 
 		 1236 aa  312  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  28.54 
 
 		 1132 aa  312  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  28.59 
 
 		 1271 aa  311  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  28.87 
 
 		 1228 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  29.23 
 
 		 1257 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  29.31 
 
 		 1208 aa  310  5e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  29.67 
 
 		 1225 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  29.6 
 
 		 1136 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  29.8 
 
 		 1226 aa  308  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  28.35 
 
 		 1261 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  29.32 
 
 		 1169 aa  308  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  30.7 
 
 		 1197 aa  308  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  29.03 
 
 		 1228 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  29.1 
 
 		 1257 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  29.34 
 
 		 1136 aa  307  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  27.8 
 
 		 1171 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  28.69 
 
 		 1169 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  27.85 
 
 		 1271 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  29.34 
 
 		 1264 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  28.74 
 
 		 1199 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  28.92 
 
 		 1156 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  29.13 
 
 		 1178 aa  303  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  29.53 
 
 		 1246 aa  303  7.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  27.99 
 
 		 1244 aa  303  9e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>