More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0199 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 242 aa  488  1e-137  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1308  TatD-related deoxyribonuclease  42.92 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.700571  normal  0.456144 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1823  TatD-related deoxyribonuclease  38.75 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00210636  hitchhiker  0.000000000367552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1295  TatD-related deoxyribonuclease  38.75 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1025  TatD-related deoxyribonuclease  38.33 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609004 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2071  TatD-related deoxyribonuclease  34.58 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.270704  normal  0.0636834 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1998  TatD-related deoxyribonuclease  36.86 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1779  TatD-related deoxyribonuclease  36.55 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  26.56 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  25.68 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  25.88 
 
 		 254 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0199  TatD-related deoxyribonuclease  27.2 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  26.38 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  30.95 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  26.56 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  25.88 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2900  Mg-dependent DNase TatD  29.75 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000278617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0256  putative deoxyribonuclease, TatD family  25.68 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2878  TatD-related deoxyribonuclease  32.51 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  29.25 
 
 		 268 aa  93.6  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  27.95 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  25.98 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  25.98 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2067  TatD-related deoxyribonuclease  26.61 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  29.73 
 
 		 271 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  29.18 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  26.38 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  30.74 
 
 		 461 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  28.4 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  27.34 
 
 		 457 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  26.74 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  28.57 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  27.49 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1040  TatD-related deoxyribonuclease  26.29 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  31.25 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  27.34 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  34.23 
 
 		 274 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3651  TatD-related deoxyribonuclease  29.6 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  29.23 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  28.52 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  27.86 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  30.08 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  29.28 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  30.68 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  29.96 
 
 		 276 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  28.12 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  27.93 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  27.93 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  27.69 
 
 		 264 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  27.34 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  30.98 
 
 		 258 aa  85.1  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  31.34 
 
 		 264 aa  85.1  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  27.86 
 
 		 263 aa  85.1  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  26.67 
 
 		 263 aa  85.1  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  28.08 
 
 		 464 aa  85.1  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  30.2 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  32.2 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  28.68 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  28.12 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  27.73 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  28.83 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  27.86 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  28.38 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  26.48 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  27.59 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  34.76 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  31.58 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  27.95 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  25.2 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  28.68 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  29.32 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  28.4 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  27.97 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  27.84 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  29.73 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  27.86 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  29.73 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  29.18 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  28.96 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  28.96 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  29.73 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  28.96 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  29.73 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  29.73 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  28.17 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  28.96 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  30.38 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  27.34 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  25.58 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  28.06 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  30.35 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1885  hydrolase, TatD family  31.27 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16447  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  27.91 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  30.35 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  28.96 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  30.15 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  28.63 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  32.16 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  29.72 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  25.98 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>