50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4019 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 		 411 aa  790    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  36.93 
 
 		 620 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  27.81 
 
 		 425 aa  155  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3833  hypothetical protein  32.75 
 
 		 550 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  29.88 
 
 		 531 aa  140  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  32.27 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  29.44 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  26.8 
 
 		 540 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  25.06 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  23.54 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  24.08 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  24.57 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  23.27 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  23.96 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  23.95 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  23.34 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  23.95 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  24.46 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  24.63 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  24.02 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  24.32 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  25.55 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  23.76 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  23.27 
 
 		 406 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  23.27 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  23.27 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  23.35 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  25.56 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  23.58 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  25.34 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  25.07 
 
 		 420 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  29.05 
 
 		 529 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  33.12 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  23.54 
 
 		 511 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  22.75 
 
 		 257 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  24.71 
 
 		 467 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  31.82 
 
 		 531 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  31.82 
 
 		 531 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  21.49 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  25 
 
 		 260 aa  47  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  27.8 
 
 		 529 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  30 
 
 		 555 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  23.83 
 
 		 253 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  24.59 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  22.77 
 
 		 869 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  29.03 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  24.44 
 
 		 475 aa  43.9  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  26.12 
 
 		 510 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  22.22 
 
 		 260 aa  43.5  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  24.29 
 
 		 421 aa  43.1  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>