More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3776 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3776  cytochrome P450  100 
 
 
413 aa  821    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.66 
 
 
405 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.66 
 
 
420 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.23 
 
 
411 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.57 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.34 
 
 
412 aa  200  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.51 
 
 
411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  36 
 
 
430 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.25 
 
 
400 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.11 
 
 
400 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.24 
 
 
411 aa  193  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  32.42 
 
 
411 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  34.34 
 
 
417 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.43 
 
 
411 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.43 
 
 
411 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  31.2 
 
 
411 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  31.42 
 
 
411 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  36.8 
 
 
414 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.15 
 
 
411 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  30.51 
 
 
411 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  31.42 
 
 
411 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.81 
 
 
402 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.61 
 
 
411 aa  187  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  35.38 
 
 
459 aa  186  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  34.88 
 
 
402 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  34.87 
 
 
397 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  35.14 
 
 
421 aa  186  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  31.61 
 
 
411 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  33.16 
 
 
396 aa  186  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  34.26 
 
 
407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  34.26 
 
 
407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  36.22 
 
 
400 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  33.89 
 
 
408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.24 
 
 
410 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  34.96 
 
 
401 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  34.58 
 
 
399 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  37.37 
 
 
398 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  33.73 
 
 
410 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  34.77 
 
 
400 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  35.86 
 
 
406 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  32.66 
 
 
405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  31.7 
 
 
408 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.14 
 
 
419 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  36.56 
 
 
423 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33.67 
 
 
398 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.4 
 
 
400 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  34.71 
 
 
415 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.49 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  32.85 
 
 
415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  31.35 
 
 
418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  32.32 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  36.11 
 
 
436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  34.88 
 
 
424 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  35.87 
 
 
399 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  32.43 
 
 
401 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  37.58 
 
 
345 aa  169  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  36.19 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  36.19 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  36.19 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  31.72 
 
 
408 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  33.6 
 
 
423 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  34.81 
 
 
406 aa  166  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  32.92 
 
 
407 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  32.75 
 
 
395 aa  166  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  32.14 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  34.46 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  33.75 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  33.87 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  37.07 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  34.28 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  34.84 
 
 
399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  31.88 
 
 
395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  34 
 
 
403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  31.54 
 
 
412 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  34.02 
 
 
395 aa  162  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  36.73 
 
 
406 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  33.01 
 
 
398 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  33.51 
 
 
404 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  36.39 
 
 
376 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  30.98 
 
 
408 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  32.34 
 
 
399 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  36.77 
 
 
382 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  34.42 
 
 
407 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0688  Cytochrome P450-like protein  35.6 
 
 
450 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.75 
 
 
388 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  33.87 
 
 
399 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  33.96 
 
 
399 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  31.99 
 
 
416 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  34.06 
 
 
408 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  32.32 
 
 
414 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  34.6 
 
 
375 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  32.6 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  36.34 
 
 
404 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  32.88 
 
 
406 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  32.84 
 
 
399 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  32.8 
 
 
405 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  32.85 
 
 
410 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  32.08 
 
 
411 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  31.27 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  33.68 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>