More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2692 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 181 aa  360  4e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  72.93 
 
 		 203 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  72.93 
 
 		 203 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  72.93 
 
 		 180 aa  264  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  73.08 
 
 		 205 aa  263  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  70.72 
 
 		 203 aa  261  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  71.27 
 
 		 197 aa  259  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  70.72 
 
 		 197 aa  257  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  70.72 
 
 		 197 aa  257  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  70.72 
 
 		 197 aa  257  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  70.17 
 
 		 197 aa  257  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  69.06 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  68.51 
 
 		 220 aa  250  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  67.58 
 
 		 208 aa  249  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  65.59 
 
 		 209 aa  248  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  66.11 
 
 		 204 aa  234  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  62.98 
 
 		 200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  63.48 
 
 		 199 aa  230  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  63.48 
 
 		 199 aa  229  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  63.19 
 
 		 206 aa  228  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  66.85 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  64.29 
 
 		 205 aa  221  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  58.79 
 
 		 206 aa  219  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  59.16 
 
 		 239 aa  216  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  59.69 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  60.96 
 
 		 208 aa  207  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  59.89 
 
 		 194 aa  207  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  56.99 
 
 		 211 aa  207  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  59.07 
 
 		 224 aa  206  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  58.55 
 
 		 212 aa  204  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  58.33 
 
 		 215 aa  203  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  55.96 
 
 		 215 aa  202  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  57.81 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  56.77 
 
 		 218 aa  198  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  57.29 
 
 		 213 aa  198  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  52.2 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  55.61 
 
 		 219 aa  184  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  51.3 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  60.51 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  50.78 
 
 		 212 aa  176  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  48.5 
 
 		 244 aa  167  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  44.75 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  41.24 
 
 		 211 aa  133  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  41.01 
 
 		 197 aa  121  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  40.22 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  37.64 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  39.78 
 
 		 283 aa  111  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  35.87 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  35.87 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  36 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  35.86 
 
 		 291 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  35.86 
 
 		 291 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  36.42 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  36.42 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  34.83 
 
 		 214 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  35.86 
 
 		 291 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.88 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.68 
 
 		 204 aa  100  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  34.68 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  35.96 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0984  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  33.53 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.553307  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.68 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  39.73 
 
 		 295 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  38.62 
 
 		 295 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  37.43 
 
 		 195 aa  99.4  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  37.08 
 
 		 298 aa  99.4  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  39.04 
 
 		 296 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  39.31 
 
 		 293 aa  99.4  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  36.31 
 
 		 205 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  36.31 
 
 		 205 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.26 
 
 		 202 aa  98.2  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  38.36 
 
 		 295 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  37.43 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  36.94 
 
 		 291 aa  97.4  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  37.67 
 
 		 295 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.1 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.1 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1088  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.95 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000882712  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  37.67 
 
 		 295 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1293  cytochrome c oxidase, subunit III  32.37 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000775501  hitchhiker  0.00406626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.2 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  36.55 
 
 		 291 aa  95.5  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  35.67 
 
 		 291 aa  95.9  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  32.67 
 
 		 297 aa  95.9  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  33.67 
 
 		 294 aa  95.5  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  37.84 
 
 		 293 aa  95.5  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0950  cytochrome c oxidase subunit III  34.48 
 
 		 214 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454047  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.53 
 
 		 215 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.66 
 
 		 211 aa  95.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  36.94 
 
 		 291 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  36.94 
 
 		 291 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  40.62 
 
 		 288 aa  94.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.68 
 
 		 202 aa  94.7  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  37.25 
 
 		 304 aa  94.7  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  36.08 
 
 		 294 aa  94.7  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  37.99 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  38.36 
 
 		 295 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4646  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.53 
 
 		 208 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0847054  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  34.98 
 
 		 293 aa  94.4  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  36.94 
 
 		 291 aa  94.4  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>