More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2137 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  66.67 
 
 		 234 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  62.13 
 
 		 261 aa  261  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  60.26 
 
 		 234 aa  258  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  63.55 
 
 		 230 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  60.2 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  59.24 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  59.24 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  59.24 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  62.39 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  56.65 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  61.73 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  59.9 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  58.5 
 
 		 230 aa  225  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  58 
 
 		 230 aa  222  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  56 
 
 		 242 aa  218  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  55.87 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  57.21 
 
 		 242 aa  215  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  59.5 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  56.5 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  52 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  51.13 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  48.7 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  48.55 
 
 		 274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  55.19 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  54 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  49.78 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  49.29 
 
 		 275 aa  187  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  48.51 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  48.13 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  38.97 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  38.94 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  40.65 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 199 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 		 201 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.37 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  36.04 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.62 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  32.32 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.84 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 		 448 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  25.39 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.14 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.13 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  26.96 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.88 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.88 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.35 
 
 		 442 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  25.85 
 
 		 447 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  24.14 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  25.53 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  28.91 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 401 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.87 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8239  putative phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 		 412 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  32.28 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.92 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.73 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 370 aa  65.5  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  45 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  23.15 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.44 
 
 		 547 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  24.48 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30.28 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>