246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2070 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 345 aa  690    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  49.04 
 
 		 366 aa  291  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  45.13 
 
 		 340 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  45.4 
 
 		 342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  46.28 
 
 		 372 aa  279  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  45.73 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  47.74 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  42.82 
 
 		 355 aa  252  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  42.77 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  42.42 
 
 		 379 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  35.5 
 
 		 353 aa  202  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  36 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  37.11 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  37.11 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  37.11 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  36.1 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  34.73 
 
 		 347 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  36.28 
 
 		 335 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  36.28 
 
 		 335 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  35.37 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  35.39 
 
 		 344 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  34.46 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  36.25 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  34.69 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  33.52 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  33.93 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  34.38 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  33.91 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  34.29 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  35.35 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  33.01 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  32.27 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  32.81 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 341 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  36.16 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  35.79 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  33.75 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  36.16 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1923  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  33.22 
 
 		 379 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1462  extracellular solute-binding protein family 1  31.61 
 
 		 392 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  33.54 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  33.2 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  33.23 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  30.82 
 
 		 329 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  34.88 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 		 372 aa  139  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  32.01 
 
 		 355 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  32.17 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  29.71 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  33.67 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 347 aa  133  5e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  33.67 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  33.66 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  32.63 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  30.16 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.85 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 		 353 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  31.31 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  33.22 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  32.09 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  32.09 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.78 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  31.78 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  32.23 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  31.45 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.78 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.78 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  30.4 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  31.71 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  29.63 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>