More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2046 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
272 aa  520  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  80.88 
 
 
272 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  78.68 
 
 
272 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  78.68 
 
 
272 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  78.68 
 
 
272 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  79.04 
 
 
272 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  78.31 
 
 
282 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  77.94 
 
 
272 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  74.72 
 
 
271 aa  384  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  74.81 
 
 
269 aa  378  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  72.76 
 
 
269 aa  371  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.78 
 
 
269 aa  368  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.8 
 
 
267 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.27 
 
 
269 aa  359  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.85 
 
 
286 aa  353  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.68 
 
 
268 aa  340  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  66.54 
 
 
270 aa  326  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.78 
 
 
270 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.4 
 
 
271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.07 
 
 
275 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.67 
 
 
269 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.42 
 
 
270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.89 
 
 
317 aa  311  4.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.5 
 
 
274 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.5 
 
 
274 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.44 
 
 
268 aa  301  9e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.3 
 
 
268 aa  300  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.31 
 
 
274 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  65.38 
 
 
287 aa  300  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.32 
 
 
268 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.14 
 
 
273 aa  259  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.98 
 
 
268 aa  254  7e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.03 
 
 
273 aa  250  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.17 
 
 
260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.21 
 
 
272 aa  242  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  59.13 
 
 
277 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.29 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.21 
 
 
259 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.35 
 
 
259 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.58 
 
 
263 aa  186  5e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.76 
 
 
270 aa  185  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.46 
 
 
257 aa  183  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.74 
 
 
258 aa  183  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.41 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.75 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.85 
 
 
271 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.15 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1174  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.12 
 
 
262 aa  179  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.43 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.67 
 
 
265 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
258 aa  178  7e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.28 
 
 
296 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.09 
 
 
257 aa  178  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
258 aa  178  9e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 
295 aa  178  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
258 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2155  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.47 
 
 
260 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.209706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.8 
 
 
260 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.74 
 
 
287 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.64 
 
 
285 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.67 
 
 
273 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
275 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.74 
 
 
259 aa  175  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.75 
 
 
263 aa  175  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  39.37 
 
 
261 aa  175  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.87 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.72 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1670  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.34 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00153325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5475  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.83 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.47 
 
 
294 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.62 
 
 
268 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.9 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.37 
 
 
285 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
260 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.32 
 
 
293 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.02 
 
 
260 aa  171  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.74 
 
 
295 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.17 
 
 
285 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  39.1 
 
 
268 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00560  anthranilate synthase, putative  46.75 
 
 
752 aa  170  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.23 
 
 
266 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.23 
 
 
265 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1800  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.8 
 
 
271 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000789952  normal  0.147475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.09 
 
 
273 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.87 
 
 
269 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.93 
 
 
263 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1322  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.84 
 
 
260 aa  169  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.17 
 
 
265 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.17 
 
 
259 aa  169  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.57 
 
 
270 aa  168  9e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.37 
 
 
271 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.42 
 
 
265 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.76 
 
 
262 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.83 
 
 
264 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.18 
 
 
297 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 
258 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.13 
 
 
267 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.64 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>