More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1835 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  100 
 
 		 494 aa  957    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  46.61 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  45.81 
 
 		 498 aa  342  7e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  42.07 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  41.54 
 
 		 502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  40.21 
 
 		 514 aa  264  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  40.21 
 
 		 505 aa  264  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  39.43 
 
 		 494 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  40.21 
 
 		 507 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  40.21 
 
 		 507 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  40.42 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  39.43 
 
 		 494 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  34.09 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  39.57 
 
 		 486 aa  226  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  35.9 
 
 		 481 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  36.44 
 
 		 525 aa  212  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  36.99 
 
 		 480 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  36.95 
 
 		 549 aa  207  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  36.97 
 
 		 522 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  38.16 
 
 		 490 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  40.13 
 
 		 508 aa  204  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  35.93 
 
 		 498 aa  204  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  32.72 
 
 		 536 aa  199  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  35.71 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  40.54 
 
 		 515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  34.97 
 
 		 547 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  33.33 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  39.65 
 
 		 572 aa  188  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  40.26 
 
 		 508 aa  186  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  39.18 
 
 		 558 aa  181  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  33.33 
 
 		 549 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  32.79 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  44.09 
 
 		 286 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  41.35 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  38.97 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.73 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  40 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  35.2 
 
 		 274 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  33.08 
 
 		 279 aa  66.6  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  34.76 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  40.74 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  32.09 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  38.41 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  39.57 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.06 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.03 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  32.09 
 
 		 210 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  40.88 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  33.8 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  35.54 
 
 		 285 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  38.06 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.84 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.38 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.76 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.31 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.38 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  35.38 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  35.38 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  36.73 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  33.85 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.38 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  35.94 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  36.57 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  23.49 
 
 		 201 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.62 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  32.62 
 
 		 286 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  33.6 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.45 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.4 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.25 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  48.86 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  29.66 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  38.35 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  38.26 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1551  HemK family modification methylase  40.15 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00225309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4966  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.62 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4605  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.62 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000649874  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.62 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.62 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.62 
 
 		 342 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3636  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.15 
 
 		 347 aa  57  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3507  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.15 
 
 		 347 aa  57  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.62 
 
 		 342 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0840  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.15 
 
 		 347 aa  57  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.62 
 
 		 342 aa  57  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.62 
 
 		 342 aa  57  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  34.62 
 
 		 262 aa  56.2  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  37.23 
 
 		 278 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.62 
 
 		 342 aa  56.6  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  39.37 
 
 		 317 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  30.33 
 
 		 359 aa  55.8  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  26.35 
 
 		 196 aa  55.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  37.3 
 
 		 280 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  40.5 
 
 		 295 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.46 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3032  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.58 
 
 		 349 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  38.94 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.21 
 
 		 322 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  38.46 
 
 		 288 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.88 
 
 		 281 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>