78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1344 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  84.7 
 
 
452 aa  804    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  908    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  82.48 
 
 
452 aa  778    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  86.7 
 
 
456 aa  823    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0047  hypothetical protein  52.01 
 
 
486 aa  486  1e-136  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  33.11 
 
 
524 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  26.03 
 
 
557 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25 
 
 
508 aa  70.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  25.35 
 
 
492 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  22.74 
 
 
524 aa  68.2  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  29.14 
 
 
1071 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  30.99 
 
 
523 aa  64.7  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  22.65 
 
 
496 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  31.87 
 
 
537 aa  63.2  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.25 
 
 
496 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  24.87 
 
 
497 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  25.33 
 
 
531 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  29.57 
 
 
582 aa  58.9  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23 
 
 
611 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  22.75 
 
 
560 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  30.99 
 
 
800 aa  57.4  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  29.3 
 
 
523 aa  57.4  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  23.71 
 
 
497 aa  57  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  23.54 
 
 
493 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  25.25 
 
 
510 aa  55.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  24.29 
 
 
497 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  25.82 
 
 
559 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  33.01 
 
 
559 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  33.06 
 
 
674 aa  53.5  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  33.33 
 
 
623 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  28.26 
 
 
524 aa  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  22.66 
 
 
540 aa  52.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  26.34 
 
 
593 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  26.43 
 
 
581 aa  50.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  26.86 
 
 
569 aa  50.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  27.95 
 
 
587 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  30.71 
 
 
600 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  30.25 
 
 
579 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  30.58 
 
 
753 aa  49.7  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  25.16 
 
 
590 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  22.7 
 
 
998 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  31.17 
 
 
563 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  22.25 
 
 
581 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.5 
 
 
500 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  26.99 
 
 
594 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  32.41 
 
 
1100 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  25.53 
 
 
537 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  34.18 
 
 
662 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  32.71 
 
 
607 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  24.24 
 
 
589 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  31.87 
 
 
709 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2524  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B  50 
 
 
186 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B  50 
 
 
183 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0386049  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  22.57 
 
 
520 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  23.23 
 
 
564 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  29.46 
 
 
1031 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  30.52 
 
 
616 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  29.91 
 
 
511 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  30.58 
 
 
734 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  35.06 
 
 
427 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  30.61 
 
 
1043 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0031  hypothetical protein  38.18 
 
 
611 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  30 
 
 
608 aa  44.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  30.83 
 
 
605 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3943  hypothetical protein  29.41 
 
 
466 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  25.93 
 
 
1076 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  27.87 
 
 
762 aa  44.3  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  30.72 
 
 
561 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  27.21 
 
 
859 aa  44.3  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  31.34 
 
 
517 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  28.41 
 
 
595 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  30.59 
 
 
526 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  26.71 
 
 
1144 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  29.41 
 
 
550 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  30.22 
 
 
658 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  30.7 
 
 
606 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  28.06 
 
 
653 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  32.89 
 
 
592 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>