More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0565 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0565  putative methyltransferase  100 
 
 
184 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000647034  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1331  hypothetical protein  44.26 
 
 
182 aa  147  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0191  hypothetical protein  41.14 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.644912  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  31.87 
 
 
183 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  32.97 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  35.2 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  37.35 
 
 
187 aa  97.8  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1395  putative methyltransferase  36.78 
 
 
175 aa  97.8  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1441  methyltransferase  36.78 
 
 
175 aa  97.8  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  32.37 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  34.22 
 
 
210 aa  97.1  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  37.5 
 
 
185 aa  95.5  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  33.53 
 
 
180 aa  94.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  31.49 
 
 
189 aa  92  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  33.15 
 
 
189 aa  91.7  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  30.65 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  30.65 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  34.21 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  36.99 
 
 
186 aa  89  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  32.78 
 
 
207 aa  88.6  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  32.22 
 
 
184 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  32.22 
 
 
198 aa  88.2  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  34.09 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  28.8 
 
 
207 aa  88.2  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  33.52 
 
 
186 aa  87  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  33.51 
 
 
187 aa  87  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  35.84 
 
 
184 aa  87  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  33.51 
 
 
187 aa  87  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  32.61 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  31.58 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  31.61 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  33.33 
 
 
186 aa  85.5  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4018  hypothetical protein  28.89 
 
 
184 aa  85.9  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  32.88 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  32.78 
 
 
185 aa  85.5  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  36.08 
 
 
200 aa  85.9  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  31.87 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  30.73 
 
 
184 aa  85.1  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  31.89 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  31.84 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  26.67 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2142  methyltransferase  30.34 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1480  hypothetical protein  30.72 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  31.32 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  30.94 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  32.18 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  28.57 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  35.63 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  31.71 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  30.22 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  28.96 
 
 
187 aa  82  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  30.16 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  30.05 
 
 
194 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  33.15 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  32.04 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  32.77 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  30.51 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  29.12 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  35.34 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  35 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  32.34 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  31.15 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  32.97 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  32.45 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  29.03 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  31.67 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  30.39 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  29.12 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2094  methyltransferase  36.91 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  34.68 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  33.33 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  33.33 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  26.46 
 
 
191 aa  79  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  31.32 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  32.6 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  33.56 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  33.56 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  29.28 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  32.19 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  31.87 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  30.51 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  29.67 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  28.33 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  31.82 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0182  hypothetical protein  33.77 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  28.89 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  31.76 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  28.89 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  32.78 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  28.33 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  28.42 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  32 
 
 
191 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  30.11 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  30.56 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  27.33 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  31.15 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0164  putative methyltransferase  31.69 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0357568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3082  methyltransferase  29.55 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>