More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2558 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 478 aa  978    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  56.08 
 
 		 489 aa  491  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.85 
 
 		 483 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  53.65 
 
 		 478 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  55.65 
 
 		 477 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  55.43 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  55.43 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  55.43 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  55.43 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  55.43 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  55.43 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.74 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.95 
 
 		 480 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.31 
 
 		 480 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  50.21 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50 
 
 		 480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.79 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  53.18 
 
 		 477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.79 
 
 		 480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  53.8 
 
 		 481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  53.08 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  49.79 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.58 
 
 		 480 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.03 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.03 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.73 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  41.7 
 
 		 488 aa  392  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  52.49 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.92 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.13 
 
 		 479 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.42 
 
 		 477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.33 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.31 
 
 		 488 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.22 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.5 
 
 		 484 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.21 
 
 		 495 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.02 
 
 		 547 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  31.11 
 
 		 499 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.82 
 
 		 552 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  28.87 
 
 		 542 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.52 
 
 		 498 aa  179  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.28 
 
 		 505 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.28 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.28 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.71 
 
 		 529 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.24 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.43 
 
 		 543 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.93 
 
 		 504 aa  176  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.37 
 
 		 504 aa  174  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.56 
 
 		 514 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  29.79 
 
 		 505 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30 
 
 		 503 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  31.86 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.92 
 
 		 503 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.49 
 
 		 523 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.68 
 
 		 504 aa  170  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.31 
 
 		 544 aa  167  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.24 
 
 		 507 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.57 
 
 		 454 aa  166  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.27 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.91 
 
 		 517 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.45 
 
 		 481 aa  161  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.8 
 
 		 528 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.87 
 
 		 546 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.85 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.43 
 
 		 475 aa  147  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.03 
 
 		 459 aa  144  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.05 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.28 
 
 		 458 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.28 
 
 		 458 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.56 
 
 		 458 aa  129  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.26 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.83 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.09 
 
 		 457 aa  124  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  25.68 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.27 
 
 		 458 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.05 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  25.78 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  24.67 
 
 		 445 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.96 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.53 
 
 		 437 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.8 
 
 		 460 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.61 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.82 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.06 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  23.89 
 
 		 482 aa  107  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  25 
 
 		 467 aa  106  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  24.57 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.05 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.11 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.71 
 
 		 454 aa  100  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.28 
 
 		 470 aa  99.8  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.14 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.76 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.96 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.73 
 
 		 491 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.65 
 
 		 462 aa  97.4  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.91 
 
 		 444 aa  97.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.64 
 
 		 465 aa  96.7  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>