99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2970 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  100 
 
 
546 aa  1061    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8364  putative siderophore biosynthesis protein  62.71 
 
 
545 aa  558  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3749  IucA/IucC family protein  50.68 
 
 
563 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.959058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  42.83 
 
 
592 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  40.04 
 
 
599 aa  270  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  41.44 
 
 
587 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  42.82 
 
 
600 aa  249  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  34.87 
 
 
602 aa  243  7.999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  39.68 
 
 
640 aa  242  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  32.72 
 
 
610 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  38.84 
 
 
570 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  31.9 
 
 
587 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  25 
 
 
588 aa  82  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  27.85 
 
 
720 aa  81.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  24.29 
 
 
584 aa  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  24.29 
 
 
584 aa  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  27.72 
 
 
577 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  25 
 
 
562 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  24.73 
 
 
610 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  30.62 
 
 
578 aa  72  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  28.15 
 
 
637 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  30.09 
 
 
595 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  26.08 
 
 
633 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  25.14 
 
 
580 aa  68.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  31.4 
 
 
629 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22.67 
 
 
653 aa  67.8  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  28.45 
 
 
610 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  24.43 
 
 
580 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  26.96 
 
 
577 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  27.6 
 
 
655 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  24.79 
 
 
627 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  27.27 
 
 
577 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  25.97 
 
 
589 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  27.57 
 
 
596 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  27.43 
 
 
655 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  24.63 
 
 
637 aa  62  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  28.31 
 
 
593 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  21.17 
 
 
592 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  21.17 
 
 
592 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  22.06 
 
 
602 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  26.38 
 
 
613 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  27.65 
 
 
594 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  22.06 
 
 
602 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  22.06 
 
 
602 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  22.06 
 
 
602 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  30.65 
 
 
557 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  31.19 
 
 
609 aa  58.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  30.72 
 
 
594 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  24.14 
 
 
602 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  22.54 
 
 
602 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.25 
 
 
580 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  27.25 
 
 
580 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  21.82 
 
 
602 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  26.01 
 
 
582 aa  56.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  28.79 
 
 
570 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  30.41 
 
 
594 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.32 
 
 
612 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  22.95 
 
 
585 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  23.6 
 
 
602 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  24.83 
 
 
585 aa  54.3  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  27.63 
 
 
602 aa  54.3  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  24.83 
 
 
585 aa  54.3  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  28.27 
 
 
991 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  25.07 
 
 
612 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  25.07 
 
 
610 aa  53.5  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  25.07 
 
 
610 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  27.46 
 
 
586 aa  53.5  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  25.07 
 
 
610 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  21.32 
 
 
575 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  23.28 
 
 
610 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  21.57 
 
 
575 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  29.32 
 
 
563 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  24.28 
 
 
606 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.03 
 
 
612 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  27.03 
 
 
998 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  26.51 
 
 
799 aa  50.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  26.5 
 
 
586 aa  50.4  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  25.65 
 
 
578 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  27.51 
 
 
1153 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  25.65 
 
 
578 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.06 
 
 
998 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  21.63 
 
 
613 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  25.48 
 
 
601 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  26.16 
 
 
1148 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0588  putative siderophore biosynthesis protein  24.29 
 
 
564 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.79 
 
 
582 aa  47.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  25.79 
 
 
582 aa  47.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  25.73 
 
 
628 aa  47.4  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  19.54 
 
 
604 aa  47.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  25.25 
 
 
635 aa  47  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  23.26 
 
 
625 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  25.29 
 
 
591 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.26 
 
 
582 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  22.66 
 
 
619 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  29.28 
 
 
615 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  26.9 
 
 
601 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  24.17 
 
 
621 aa  44.3  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  23.11 
 
 
584 aa  43.9  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  25.86 
 
 
574 aa  43.9  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>