103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2211 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2211  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 222 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144961  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  42.31 
 
 		 260 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  40.85 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  44.37 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  38.83 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  37.32 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  39.63 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  37.76 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  32.54 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  40.62 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  36.84 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  48.08 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  36.91 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4158  peptidase A24A prepilin type IV  43.28 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.904391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  34.84 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  24.62 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  38.57 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  39.13 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  35.78 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  33.92 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  35.82 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  37.13 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  36.5 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  24.24 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  31.79 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.71 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  32.43 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  34.85 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  34.3 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2644  peptidase A24A, prepilin type IV  40.44 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  35.47 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2350  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 133 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.747166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2397  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 133 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2391  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 133 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.300874  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  34.88 
 
 		 288 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  31.14 
 
 		 266 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  31.14 
 
 		 266 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  40.23 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  27.86 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  33.71 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  33.71 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  26.92 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  33.51 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  34.1 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.62 
 
 		 283 aa  49.3  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  36.97 
 
 		 147 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3054  peptidase A24A prepilin type IV  49.37 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1154  peptidase A24A-like protein  36.05 
 
 		 250 aa  48.5  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0421152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  30.99 
 
 		 302 aa  48.5  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  31.18 
 
 		 291 aa  48.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.2 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  28.65 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1037  peptidase A24A domain protein  32.26 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.869777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  34.2 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  29.02 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3154  peptidase A24A prepilin type IV  43.97 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  30.22 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  33.85 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  33.33 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  35.04 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  35.83 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.65 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  34.04 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  28.11 
 
 		 308 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  40.45 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  28.11 
 
 		 308 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  28.65 
 
 		 304 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  32.62 
 
 		 303 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  31.25 
 
 		 287 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  34.08 
 
 		 267 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  30 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1719  hypothetical protein  36.43 
 
 		 221 aa  45.1  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  32.12 
 
 		 303 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  32.12 
 
 		 303 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.09 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.65 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.17 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.12 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  23.84 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  32.12 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  32.62 
 
 		 303 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  30.18 
 
 		 287 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0510  peptidase A24A prepilin type IV  25.22 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0178991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  30.22 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  33.71 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1411  peptidase A24A prepilin type IV  37.84 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  33.11 
 
 		 142 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  31.89 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  36.11 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  30.51 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  29.65 
 
 		 303 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  36.49 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2827  type 4 prepilin peptidase bifunctionnal: leader peptidase and N-methyltransferase transmembrane protein  30.77 
 
 		 294 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00920454  normal  0.142968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0807  peptidase A24A prepilin type IV  37.5 
 
 		 160 aa  42.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  27.47 
 
 		 290 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.17 
 
 		 247 aa  42.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  33.72 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.43 
 
 		 308 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.43 
 
 		 309 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  32.79 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>