172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1348 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 270 aa  535  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  65.3 
 
 		 264 aa  332  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.13 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8817  hypothetical protein  44.12 
 
 		 276 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.432511  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.98 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9263  hypothetical protein  41.57 
 
 		 381 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.553952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18110  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459182  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.59 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1939  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 187 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.19325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.56 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5894  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.26 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.52 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.52 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.07 
 
 		 587 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.77 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  43.28 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.27 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  43.28 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0518  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.47 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  44.44 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.24 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.93 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.62 
 
 		 864 aa  56.6  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  34.83 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  34 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5152  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.65 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.84 
 
 		 487 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  42.19 
 
 		 423 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  35.38 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 422 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  32.12 
 
 		 408 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.44 
 
 		 549 aa  52.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  45.61 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.06 
 
 		 274 aa  52  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 		 405 aa  52  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  32.93 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 198 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.64 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.31 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  39.78 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  35.05 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.43 
 
 		 128 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  36.71 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  35.17 
 
 		 450 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  45.76 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.59 
 
 		 792 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.98 
 
 		 332 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.72 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.62 
 
 		 575 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3528  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.73 
 
 		 389 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.44 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  42.37 
 
 		 383 aa  49.7  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.33 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  41.94 
 
 		 229 aa  48.9  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 544 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.65 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  37.84 
 
 		 438 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6616  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  33.04 
 
 		 575 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  36.22 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  41.67 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  36.11 
 
 		 412 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  36.89 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  28.26 
 
 		 480 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  40.3 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  34.04 
 
 		 588 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  40.32 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  46.15 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.53 
 
 		 372 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  30.99 
 
 		 478 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 667 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  33.7 
 
 		 454 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  50.98 
 
 		 419 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 143 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 395 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 		 412 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  39.06 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 1089 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  30.99 
 
 		 469 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  30.99 
 
 		 478 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  30.99 
 
 		 478 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  30.99 
 
 		 469 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  53.19 
 
 		 418 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  30.99 
 
 		 469 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 528 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  30.99 
 
 		 478 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.36 
 
 		 182 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  43.55 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  30.99 
 
 		 478 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>