92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3528 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3528  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
389 aa  796    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5152  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.74 
 
 
358 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0696  TPR repeat-containing protein  54.82 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0724  TPR repeat-containing protein  54.22 
 
 
392 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5007  hypothetical protein  55.38 
 
 
398 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.68 
 
 
487 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.81 
 
 
249 aa  60.1  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  41.77 
 
 
228 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  43.53 
 
 
225 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  27.66 
 
 
958 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48 
 
 
236 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.46 
 
 
305 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
1343 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  42.86 
 
 
229 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  46.27 
 
 
224 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  47.76 
 
 
232 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  54.84 
 
 
454 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.41 
 
 
395 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  44.83 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  50 
 
 
264 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  41.67 
 
 
241 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.71 
 
 
283 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  44.44 
 
 
247 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  42.59 
 
 
239 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  35.24 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.73 
 
 
270 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  41.79 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  29.2 
 
 
501 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 
508 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.59 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.28 
 
 
77 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  34.29 
 
 
259 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  34.29 
 
 
259 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.67 
 
 
326 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.76 
 
 
575 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  34.29 
 
 
259 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.19 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.54 
 
 
510 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  44.44 
 
 
236 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  39.73 
 
 
762 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  43.08 
 
 
426 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.24 
 
 
245 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.33 
 
 
288 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.33 
 
 
399 aa  46.6  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.18 
 
 
253 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.18 
 
 
253 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  47.73 
 
 
420 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  37.18 
 
 
253 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  37.18 
 
 
253 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.18 
 
 
253 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.18 
 
 
253 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  38.14 
 
 
267 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1270  negative regulator of AmpC, AmpD  40 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  31.17 
 
 
476 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1042  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.67 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.08 
 
 
315 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.27 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.93 
 
 
524 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.55 
 
 
192 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.57 
 
 
493 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.51 
 
 
243 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
580 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  32.93 
 
 
231 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  42.05 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.33 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  42.03 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  41.27 
 
 
204 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  35.16 
 
 
243 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.98 
 
 
101 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.808601  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.45 
 
 
1412 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.1 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  38.6 
 
 
406 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.75 
 
 
223 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  42.86 
 
 
228 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8817  hypothetical protein  24.14 
 
 
276 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.432511  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  44.44 
 
 
242 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.6 
 
 
471 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  48.08 
 
 
234 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.29 
 
 
214 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.67 
 
 
268 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  46.43 
 
 
349 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  40.91 
 
 
267 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.51 
 
 
266 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.74 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21900  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.94 
 
 
263 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  31 
 
 
176 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.74 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.76 
 
 
360 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.68 
 
 
160 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.24 
 
 
370 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6183  1 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.79 
 
 
283 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.68 
 
 
382 aa  42.7  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>