73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9263 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9263  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  756    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.553952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8817  hypothetical protein  47.68 
 
 		 276 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.432511  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.57 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.97 
 
 		 243 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  36.65 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.83 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18110  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  38.17 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459182  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1939  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.19325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.5 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.16 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.44 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  40 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  43.84 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.97 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  23.97 
 
 		 2449 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.33 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.33 
 
 		 395 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  32.71 
 
 		 239 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.56 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  36 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  36 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.34 
 
 		 266 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  36 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.92 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.28 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.62 
 
 		 283 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  39.51 
 
 		 228 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  45.28 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 306 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  41.18 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  33.72 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  32.95 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  41.51 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.62 
 
 		 575 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  31.13 
 
 		 204 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  40.62 
 
 		 229 aa  46.2  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  39.06 
 
 		 423 aa  46.2  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.16 
 
 		 128 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 77 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  40.54 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4218  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.38 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  32.22 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6616  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.66 
 
 		 528 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.68 
 
 		 792 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1933  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.46 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.97 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  41.51 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.54 
 
 		 629 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.56 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.32 
 
 		 549 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.67 
 
 		 531 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1288  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain/peptidoglycan binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 617 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  36.51 
 
 		 232 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 508 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  30.47 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1408  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.51 
 
 		 478 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3583  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.5 
 
 		 344 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  38.24 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  36.49 
 
 		 241 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  37.84 
 
 		 392 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.19 
 
 		 160 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.71 
 
 		 372 aa  43.1  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  41.51 
 
 		 396 aa  42.7  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1570  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.75 
 
 		 391 aa  42.7  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.408091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 160 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>