More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2759 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 260 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  79.76 
 
 		 258 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  76.31 
 
 		 262 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  76.89 
 
 		 252 aa  380  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  73.73 
 
 		 260 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  79.5 
 
 		 270 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  72.94 
 
 		 268 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  72.55 
 
 		 268 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  72.16 
 
 		 260 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  70.97 
 
 		 259 aa  368  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  72.66 
 
 		 258 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  71.54 
 
 		 257 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  71.61 
 
 		 253 aa  348  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  71.61 
 
 		 253 aa  348  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  67.21 
 
 		 255 aa  342  4e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  70.46 
 
 		 266 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  71.26 
 
 		 256 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  71.26 
 
 		 256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  67.08 
 
 		 257 aa  319  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  39.43 
 
 		 610 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 		 572 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  39.43 
 
 		 610 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 		 571 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  39.58 
 
 		 568 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 		 606 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  38.67 
 
 		 619 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  38.67 
 
 		 623 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 563 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  38.06 
 
 		 558 aa  178  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 		 619 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  38.67 
 
 		 619 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.65 
 
 		 594 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 573 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 		 629 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 573 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 585 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 		 606 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 568 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  35.98 
 
 		 563 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  40.64 
 
 		 568 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.75 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.24 
 
 		 552 aa  169  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 567 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  40.24 
 
 		 575 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  40.24 
 
 		 575 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 244 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  41.18 
 
 		 567 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 		 593 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 		 567 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 		 572 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  37.3 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  39.3 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.3 
 
 		 535 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.29 
 
 		 536 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  34.32 
 
 		 389 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 395 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 		 401 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  29.82 
 
 		 400 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  28.97 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 		 399 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 234 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  29.62 
 
 		 386 aa  99.4  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.89 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 344 aa  89  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.03 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  32.14 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 222 aa  72  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  35.76 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.77 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.87 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.56 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.8 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.7 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.85 
 
 		 809 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.65 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.9 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1630  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.27 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.21 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.15 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.21 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>