More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1370 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  100 
 
 		 144 aa  296  6e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  46.67 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  43.45 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  42.75 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  42.18 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  42.18 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  42.18 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  41.72 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  41.72 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  41.72 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  42.18 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  41.22 
 
 		 513 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  36.73 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  42.86 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  40.27 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  38.62 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 		 161 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  39.07 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  36.05 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  43.27 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  40.34 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 		 164 aa  84.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  36.49 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 		 170 aa  83.6  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  30.67 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  38.76 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  37.07 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  39.42 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.1 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  29.86 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  29.86 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  31.3 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  33.76 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  30.41 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  35.1 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  31.41 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  36.97 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  29.86 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  28.87 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  28.17 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  28.17 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  28.17 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  29.87 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1736  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.619884  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  35.9 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  29.45 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  29.45 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  29.1 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  35.79 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>