More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1672 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1672  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 435 aa  850    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 500 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 547 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 498 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  24.95 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.71 
 
 		 517 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  30.61 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  25.78 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  26.46 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.59 
 
 		 490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.28 
 
 		 477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  30.23 
 
 		 484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  28.61 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  26.46 
 
 		 482 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  26.02 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.64 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 482 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.83 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  25.5 
 
 		 477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 477 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  26.41 
 
 		 482 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.18 
 
 		 473 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  25.15 
 
 		 477 aa  126  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 478 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 476 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  27.65 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  29.04 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  25 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4344  GntR family transcriptional regulator  30.02 
 
 		 476 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266344  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.28 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  26.37 
 
 		 478 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.44 
 
 		 477 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 477 aa  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  30.62 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.15 
 
 		 487 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0968  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 497 aa  123  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.842177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 477 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.55 
 
 		 464 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 470 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.37 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  23.65 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  25.85 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 493 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  24.55 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  23.61 
 
 		 477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 478 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  26.23 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4286  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 497 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1330  GntR family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 464 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.33 
 
 		 470 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3329  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 515 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.895754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2903  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 498 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  24.26 
 
 		 477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 515 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5231  putative transcriptional regulator, GntR family  34.92 
 
 		 466 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  24.02 
 
 		 503 aa  119  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 393 aa  120  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.51 
 
 		 496 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.68 
 
 		 491 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.29 
 
 		 482 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  26.35 
 
 		 463 aa  119  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.23 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4518  GntR family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3850  GntR family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 524 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  27.02 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  23.27 
 
 		 480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.09 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>