More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3676 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 1043 aa  2107    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  49.11 
 
 		 1017 aa  907    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  31.68 
 
 		 904 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  31.91 
 
 		 904 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  29.43 
 
 		 903 aa  396  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.85 
 
 		 906 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.49 
 
 		 904 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  30.72 
 
 		 962 aa  347  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  30.7 
 
 		 943 aa  345  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  30.14 
 
 		 882 aa  311  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0722  ATPase  28.23 
 
 		 834 aa  278  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  24.77 
 
 		 828 aa  271  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  26.12 
 
 		 833 aa  269  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  25.95 
 
 		 831 aa  247  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  23.32 
 
 		 887 aa  164  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2552  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  33.03 
 
 		 429 aa  141  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263362  normal  0.0193136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6102  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  27.41 
 
 		 357 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  24.41 
 
 		 717 aa  110  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  22.03 
 
 		 575 aa  108  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8076  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  26.96 
 
 		 366 aa  107  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0419545  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  22.33 
 
 		 580 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  22.38 
 
 		 580 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  22.14 
 
 		 695 aa  102  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.34 
 
 		 1024 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  23.95 
 
 		 607 aa  98.6  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  22.75 
 
 		 765 aa  98.2  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  24.54 
 
 		 663 aa  97.8  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  23.61 
 
 		 976 aa  97.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  25.07 
 
 		 680 aa  96.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  24.23 
 
 		 691 aa  95.9  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  20.2 
 
 		 637 aa  95.9  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  23.11 
 
 		 930 aa  95.5  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.43 
 
 		 1000 aa  95.1  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  24.38 
 
 		 663 aa  94.4  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  24.14 
 
 		 971 aa  93.2  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  22.65 
 
 		 614 aa  93.6  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  23.15 
 
 		 975 aa  93.2  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.9 
 
 		 1013 aa  92.8  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  21.06 
 
 		 637 aa  92.8  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.12 
 
 		 721 aa  92.8  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  20.89 
 
 		 618 aa  92.4  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  20.76 
 
 		 636 aa  92  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  24.05 
 
 		 980 aa  91.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  24.87 
 
 		 641 aa  91.7  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  20.63 
 
 		 618 aa  91.7  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  23.65 
 
 		 649 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.83 
 
 		 1016 aa  90.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  24.06 
 
 		 614 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  26.26 
 
 		 982 aa  90.1  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  20.11 
 
 		 627 aa  90.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  21.88 
 
 		 733 aa  90.1  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.21 
 
 		 1008 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.21 
 
 		 1008 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  21.56 
 
 		 631 aa  89.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  22.37 
 
 		 634 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  25.83 
 
 		 1012 aa  89.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  22.96 
 
 		 661 aa  89  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.83 
 
 		 586 aa  89  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  20.77 
 
 		 572 aa  88.6  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  23.81 
 
 		 672 aa  88.2  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  23.02 
 
 		 592 aa  87.8  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.07 
 
 		 586 aa  87.8  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  21.5 
 
 		 574 aa  87.4  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.03 
 
 		 598 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  18.98 
 
 		 608 aa  87.4  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  21.5 
 
 		 574 aa  87.4  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  22.92 
 
 		 586 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  24.12 
 
 		 665 aa  87.4  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  22.74 
 
 		 582 aa  87.4  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3308  ABC transporter related  24.1 
 
 		 586 aa  87.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682367  hitchhiker  0.0000512121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  19.47 
 
 		 626 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  21.97 
 
 		 636 aa  86.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.03 
 
 		 598 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  23.81 
 
 		 672 aa  86.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  20.65 
 
 		 628 aa  86.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  19.66 
 
 		 584 aa  87  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.81 
 
 		 1018 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  22.02 
 
 		 578 aa  86.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  23.13 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  23.13 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  23.36 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  21.39 
 
 		 623 aa  85.9  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  21.24 
 
 		 607 aa  85.5  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.13 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.13 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  19.74 
 
 		 629 aa  85.9  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.82 
 
 		 586 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  21.31 
 
 		 608 aa  85.1  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.34 
 
 		 622 aa  85.1  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0117  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  20.84 
 
 		 574 aa  84.7  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  22.49 
 
 		 577 aa  84.7  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  20.05 
 
 		 586 aa  84.3  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  21 
 
 		 645 aa  84.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  22.57 
 
 		 617 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  21.79 
 
 		 610 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  23.6 
 
 		 631 aa  84.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.4 
 
 		 702 aa  84  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  22.22 
 
 		 592 aa  84  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.29 
 
 		 671 aa  84.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  22.11 
 
 		 589 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>