80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0487 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0487  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 
201 aa  400  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.670456  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2497  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.24 
 
 
223 aa  151  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.236473  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0565  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.26 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4188  hypothetical protein  41.67 
 
 
197 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2268  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.16 
 
 
194 aa  122  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49040  hypothetical protein  41.67 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414994  hitchhiker  0.000000057782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2963  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.25 
 
 
197 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.954883  normal  0.0137072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.72 
 
 
225 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00181  DnaJ-related protein  34.03 
 
 
227 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1585  heat shock protein DnaJ-like  34.48 
 
 
252 aa  98.2  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0483  heat shock protein DnaJ-like  31.37 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000132964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4084  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.1 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000392536  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0728  DnaJ family protein  31.47 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05806  formate dehydrogenase  31.88 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0725  putative DnaJ-related protein  28.57 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  28.57 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1905  hypothetical protein  28.28 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0687  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.39 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0724  heat shock protein DnaJ-like protein  32.39 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0965  heat shock protein DnaJ domain protein  31.43 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3397  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.43 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.330365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.43 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0976  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.43 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3035  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.14 
 
 
214 aa  58.2  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0819  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.13 
 
 
219 aa  58.2  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0797  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.95 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2933  heat shock protein DnaJ-like protein  27.04 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.548763  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3062  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.71 
 
 
214 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0198351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0875  formate dehydrogenase  30.71 
 
 
214 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  0.42894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.71 
 
 
214 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.634655  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3716  DnaJ domain-containing protein  30 
 
 
214 aa  54.7  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1370  heat shock protein DnaJ-like  53.85 
 
 
231 aa  52  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3786  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.95 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_42151  predicted protein  45.65 
 
 
402 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2790  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.94 
 
 
130 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_19643  predicted protein  43.48 
 
 
423 aa  48.1  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0479063  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01371  putative heat shock protein DnaJ  36 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.333222 
 
 
-
 
NC_002978  WD1074  DnaJ domain-containing protein  28.12 
 
 
102 aa  46.6  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0316124  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38015  predicted protein  43.48 
 
 
398 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.964635  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02230  chaperone, putative  34.18 
 
 
97 aa  47  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3995  heat shock protein DnaJ domain protein  46.15 
 
 
96 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000305927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4540  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.1 
 
 
242 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0499659  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0801  heat shock protein DnaJ, N-terminal  39.62 
 
 
140 aa  46.2  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  44.9 
 
 
258 aa  45.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.84 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47749  predicted protein  46.51 
 
 
327 aa  45.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0791  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.81 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.267414 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0201  dnaJ domain-containing protein  40.38 
 
 
79 aa  44.3  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.138312  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  43.48 
 
 
336 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26301  putative heat shock protein DnaJ  45.65 
 
 
232 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3329  heat shock protein DnaJ-like  43.14 
 
 
245 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69308  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1396  DnaJ domain-containing protein  43.4 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1860  aconitate hydratase 2  32.58 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  42 
 
 
322 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  46.51 
 
 
235 aa  42.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.16 
 
 
206 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.51 
 
 
235 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  45.1 
 
 
2272 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  42.55 
 
 
316 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.84 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0976  heat shock protein DnaJ-like  42.31 
 
 
256 aa  42.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.156674  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0096  chaperone DnaJ domain protein  39.13 
 
 
310 aa  42.4  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.274204 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0553  heat shock protein DnaJ domain protein  31.75 
 
 
255 aa  42.7  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01941  putative heat shock protein DnaJ  47.22 
 
 
217 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04310  chaperone regulator, putative  41.3 
 
 
404 aa  42.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00566214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1700  heat shock protein DnaJ  41.18 
 
 
298 aa  42.4  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.20246  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0826  heat shock protein DnaJ domain protein  29.41 
 
 
241 aa  42.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000315568  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0818  DnaJ domain-containing protein  38.46 
 
 
128 aa  42.4  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  48.84 
 
 
206 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  48.98 
 
 
324 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3451  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.83 
 
 
169 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.658734  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07800  hypothetical protein  44.44 
 
 
252 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0234725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  46.51 
 
 
237 aa  41.6  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1036  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  42  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1763  dnaJ domain-containing protein  44.68 
 
 
96 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0456509  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1489  putative heat shock protein DnaJ  32.65 
 
 
216 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  54.29 
 
 
381 aa  41.2  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  41.3 
 
 
315 aa  41.6  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  41.86 
 
 
338 aa  41.2  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3560  heat shock protein DnaJ domain protein  41.18 
 
 
242 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>