More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2646 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2646  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 200 aa  408  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0947  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 348 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0173239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1193  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 347 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.533683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1768  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.375976  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2575  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.94 
 
 		 350 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.5726  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3858  ABC transporter related  35.42 
 
 		 348 aa  128  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  37.76 
 
 		 359 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  36.67 
 
 		 259 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3785  ABC transporter related  37.5 
 
 		 363 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355345 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4908  ABC transporter related  35.94 
 
 		 359 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  34.41 
 
 		 264 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  38.22 
 
 		 458 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.73 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0515  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  38.42 
 
 		 398 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  36.32 
 
 		 343 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  37.24 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4820  ABC transporter related  36.46 
 
 		 359 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1283  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  33.83 
 
 		 397 aa  122  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624021 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 343 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 276 aa  122  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  37.16 
 
 		 253 aa  122  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 		 343 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  34.83 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  36.92 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  37.57 
 
 		 448 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4109  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  36.84 
 
 		 407 aa  122  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 333 aa  121  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 366 aa  121  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 333 aa  121  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  35.94 
 
 		 448 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  37.97 
 
 		 333 aa  121  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  32.49 
 
 		 389 aa  121  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.31 
 
 		 349 aa  121  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 333 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  36.22 
 
 		 257 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  36.89 
 
 		 350 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3057  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  36.98 
 
 		 363 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3786  ABC transporter related  34.8 
 
 		 305 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  35.83 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3209  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  36.7 
 
 		 398 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  36.51 
 
 		 432 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  36.51 
 
 		 432 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  35.64 
 
 		 261 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  37.87 
 
 		 259 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  36.9 
 
 		 256 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2830  ABC transporter related  37.5 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.461635  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  36.22 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  34.92 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  36.22 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1542  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  38.95 
 
 		 407 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0120779  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  35.94 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  36.22 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  35.82 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  35.29 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  34.22 
 
 		 311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  36.07 
 
 		 260 aa  118  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4567  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.51 
 
 		 389 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5092  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.51 
 
 		 389 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.571422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  35.03 
 
 		 457 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  36.61 
 
 		 259 aa  118  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0929  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  34.34 
 
 		 242 aa  118  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.285427  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0892  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  34.34 
 
 		 242 aa  118  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.495443  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  33.85 
 
 		 267 aa  118  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1817  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.5 
 
 		 412 aa  118  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515107  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0455  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  32.98 
 
 		 389 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144019  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  32.43 
 
 		 367 aa  118  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2279  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 215 aa  117  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  34.13 
 
 		 293 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  36.73 
 
 		 355 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5107  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.51 
 
 		 389 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2521  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  36.32 
 
 		 417 aa  117  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1000  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  34.34 
 
 		 242 aa  117  9e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.64 
 
 		 240 aa  117  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3195  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  33.51 
 
 		 389 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5172  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.51 
 
 		 389 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00993584  normal  0.408818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  35.38 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  35.5 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2273  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.51 
 
 		 399 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  35.03 
 
 		 457 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  34.98 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.15 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  35.48 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  34.67 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5762  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  36.32 
 
 		 429 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0824  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  35.38 
 
 		 402 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.325184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  32.99 
 
 		 313 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  37.5 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4935  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3900  ABC transporter related  35.86 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4540  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  35.75 
 
 		 340 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 256 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  37.76 
 
 		 437 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0658  ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.64 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  38.42 
 
 		 255 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  35.56 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.64 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>