More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2603 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  39.42 
 
 		 871 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2603  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 891 aa  1834    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.67 
 
 		 859 aa  630  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 		 872 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0827  DNA mismatch repair protein MutS  41.62 
 
 		 862 aa  620  1e-176  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 		 872 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 		 869 aa  611  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  39.66 
 
 		 932 aa  611  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 862 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  38.89 
 
 		 872 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  40.47 
 
 		 894 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  38.38 
 
 		 870 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  39.66 
 
 		 868 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 910 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  41.73 
 
 		 910 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  41.78 
 
 		 873 aa  601  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  37.21 
 
 		 891 aa  601  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 		 870 aa  596  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  37.9 
 
 		 881 aa  598  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  38.41 
 
 		 862 aa  597  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  42.74 
 
 		 897 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 		 863 aa  595  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  38.73 
 
 		 872 aa  593  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 		 872 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 		 873 aa  591  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  40.6 
 
 		 896 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  39.38 
 
 		 868 aa  588  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  38.76 
 
 		 854 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 		 900 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  38.52 
 
 		 889 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  37.04 
 
 		 875 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  38.61 
 
 		 856 aa  579  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  38.24 
 
 		 870 aa  581  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  38.4 
 
 		 882 aa  580  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  41.33 
 
 		 858 aa  580  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  37.97 
 
 		 855 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 865 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  38.4 
 
 		 896 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  37.5 
 
 		 871 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  38.45 
 
 		 867 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  36.82 
 
 		 887 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  37.4 
 
 		 853 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  38.27 
 
 		 848 aa  575  1.0000000000000001e-162  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  37.96 
 
 		 861 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  37.75 
 
 		 857 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  37.72 
 
 		 861 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  40.69 
 
 		 858 aa  571  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  39.44 
 
 		 882 aa  570  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  37.68 
 
 		 863 aa  572  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  37.83 
 
 		 861 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  37.22 
 
 		 861 aa  569  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  37.32 
 
 		 856 aa  569  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  37.35 
 
 		 871 aa  571  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  38.62 
 
 		 878 aa  571  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  38 
 
 		 868 aa  570  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  37.65 
 
 		 863 aa  567  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  37.86 
 
 		 856 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  37.06 
 
 		 880 aa  566  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  36.95 
 
 		 872 aa  568  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  37.86 
 
 		 856 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  36.86 
 
 		 853 aa  567  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  38.14 
 
 		 869 aa  566  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  37.46 
 
 		 869 aa  565  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  40.61 
 
 		 858 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  37.47 
 
 		 872 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  38.63 
 
 		 860 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  36.56 
 
 		 881 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  37.47 
 
 		 922 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 874 aa  565  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 823 aa  563  1.0000000000000001e-159  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  37.64 
 
 		 856 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  37.86 
 
 		 856 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  37.29 
 
 		 863 aa  559  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  36.28 
 
 		 854 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  37.28 
 
 		 856 aa  561  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  36.43 
 
 		 859 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  37.25 
 
 		 852 aa  560  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  35.99 
 
 		 860 aa  561  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  39.06 
 
 		 863 aa  559  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  40.15 
 
 		 862 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  39.89 
 
 		 850 aa  559  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  39.33 
 
 		 828 aa  560  1e-158  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  38.82 
 
 		 873 aa  558  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  37.37 
 
 		 859 aa  557  1e-157  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  37.18 
 
 		 854 aa  559  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  38.64 
 
 		 898 aa  556  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  38.35 
 
 		 860 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  36.07 
 
 		 904 aa  559  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 804 aa  556  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 		 887 aa  558  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  37.7 
 
 		 871 aa  557  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  36.33 
 
 		 910 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  36.06 
 
 		 851 aa  555  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  37.28 
 
 		 854 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  39.9 
 
 		 804 aa  555  1e-156  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  38.64 
 
 		 872 aa  555  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  36.54 
 
 		 862 aa  555  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  38.64 
 
 		 872 aa  555  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  37.35 
 
 		 886 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  37.6 
 
 		 884 aa  551  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>