189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2356 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2356  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  100 
 
 		 309 aa  637    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4374  periplasmic binding protein  30 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4673  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.59 
 
 		 293 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4441  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.69 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4660  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.94 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4786  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  30.69 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4280  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.36 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0936488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4291  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.69 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.62 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0213  putative iron chelate uptake ABC transporter, solute-binding protein  32.56 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0212  putative ferrichrome ABC transporter periplasmic-binding protein  32.56 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0582  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.33 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.818084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4655  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.61 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1180  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  30.82 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000254745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1192  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.842601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1214  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0039818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0748  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.48 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.16 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.16 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4597  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.16 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4449  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.16 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4450  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.76 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4488  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.52 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4502  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.44 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4216  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4113  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.61 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  23.22 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  25.17 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.22 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  22.1 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.64 
 
 		 483 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  26.81 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  22.81 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  23.15 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  22.33 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.31 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.09 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  26.21 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  20.75 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  23.19 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1764  periplasmic binding protein  24.09 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4079  periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000203821  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  20.51 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  22.79 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  24.73 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  25.09 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  24.82 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  22.19 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  23.49 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3454  periplasmic binding protein  23.72 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0575769  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4800  periplasmic binding protein  22.26 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000643232  hitchhiker  0.00663707 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  24.32 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  20.39 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  25 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1763  hemin-binding periplasmic protein HmuT  26.14 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  22.67 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  22.67 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.65 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2392  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.191932  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  25 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0592  periplasmic binding protein  23.6 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0657  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.713656  normal  0.916099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0983  periplasmic binding protein  23.79 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  22.95 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 662 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  22.81 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  21.62 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4396  periplasmic binding protein  27.44 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  24.6 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1005  periplasmic binding protein  23.39 
 
 		 275 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4008  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2947  periplasmic binding protein  24.38 
 
 		 275 aa  53.1  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  29.65 
 
 		 300 aa  52.8  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  23.72 
 
 		 278 aa  52.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1017  periplasmic binding protein  23.39 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3358  periplasmic binding protein  23.39 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  23.74 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3093  periplasmic binding protein  18.88 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712568 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  19.75 
 
 		 407 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  21.75 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  22.83 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  24.03 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  24.15 
 
 		 377 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 321 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  21.68 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  21.68 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>