234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4396 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4396  periplasmic binding protein  100 
 
 		 325 aa  646    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2627  periplasmic binding protein  79.53 
 
 		 301 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3079  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  58.87 
 
 		 312 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3806  periplasmic binding protein  56.6 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.17678 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4264  transport system permease protein  53.58 
 
 		 293 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  44.8 
 
 		 309 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0675  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  44.8 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3797  periplasmic binding protein  44.18 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0661  periplasmic binding protein  41.3 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1005  periplasmic binding protein  41.05 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2404  periplasmic binding protein  39.22 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0899785  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  42.28 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1907  periplasmic binding protein  39.86 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.217732  normal  0.206334 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  39.21 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  39.21 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  39.21 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  40.71 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34400  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  36.79 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1111  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  35.08 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  37.14 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2366  periplasmic binding protein  36.46 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.10704 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  35.58 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3787  periplasmic binding protein  39.86 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  33.55 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0300  periplasmic binding protein  38.52 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0734  periplasmic binding protein  35.64 
 
 		 348 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  33.89 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  29.79 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  31.23 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000332  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  30.96 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000938047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  31.88 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1354  enterochelin ABC transporter, periplasmic enterochelin-binding protein, authentic frameshift  33.08 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3666  periplasmic binding protein  29.89 
 
 		 333 aa  155  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1393  periplasmic binding protein  38.03 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3340  periplasmic binding protein  28.22 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.002385  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  29.62 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  31.29 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.8 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1007  iron-compound ABC transporter, iron-compound-binding protein  30.04 
 
 		 342 aa  126  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00224248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0403  transferrin receptor  26.2 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.400692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5226  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.73 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0777  periplasmic binding protein  25.86 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0760  periplasmic binding protein  25.86 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5247  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.53 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5234  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.29 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4953  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00660828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0007  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.82 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5330  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.7 
 
 		 333 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00008609  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4795  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.47 
 
 		 337 aa  99  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000034871  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4815  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.7 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000198288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2663  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5197  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.7 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4918  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000189068  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25350  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  29.01 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2916  periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.421383  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0634  periplasmic binding protein  25.16 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000010772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30540  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  28.08 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0949  transferrin receptor  24.21 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0298481  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04580  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  31.27 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.398248  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16600  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  27.24 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2663  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3702  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0648  hemin-binding periplasmic protein HmuT  24.73 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 662 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1770  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  27.54 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3293  periplasmic binding protein  28.79 
 
 		 288 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  30.6 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  29.33 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  29.32 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  31.97 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  37.14 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.21 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.4 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  31.94 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2356  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  27.44 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  25.12 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4216  periplasmic binding protein  24.35 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1282  periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  28.29 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4450  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.62 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4502  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.62 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4488  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.82 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.26 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4449  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.26 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.26 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4113  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.62 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  25 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4597  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.26 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  30.38 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0748  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.91 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  30.38 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.45 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  31.58 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4673  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.48 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.83 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>