More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1001 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  100 
 
 
333 aa  690    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000332  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  58.28 
 
 
302 aa  378  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000938047  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  54.97 
 
 
302 aa  361  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  38.71 
 
 
316 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  35.82 
 
 
315 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2404  periplasmic binding protein  36.65 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0899785  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3787  periplasmic binding protein  38.11 
 
 
314 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  34.78 
 
 
321 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34400  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  33.33 
 
 
302 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  31.75 
 
 
309 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3797  periplasmic binding protein  34.49 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0675  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  31.75 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1005  periplasmic binding protein  31.72 
 
 
341 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2366  periplasmic binding protein  33.81 
 
 
318 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.10704 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  33.33 
 
 
317 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  33.33 
 
 
317 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
317 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  32.36 
 
 
322 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  33.45 
 
 
316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  32.4 
 
 
316 aa  165  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0300  periplasmic binding protein  34.17 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0734  periplasmic binding protein  34.41 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1393  periplasmic binding protein  35.14 
 
 
340 aa  162  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0393092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  31.56 
 
 
340 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  29.08 
 
 
327 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4396  periplasmic binding protein  31.91 
 
 
325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  31.72 
 
 
307 aa  150  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1111  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.1 
 
 
307 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  28.06 
 
 
339 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3340  periplasmic binding protein  28.06 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.002385  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4264  transport system permease protein  29.14 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3666  periplasmic binding protein  27.7 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1354  enterochelin ABC transporter, periplasmic enterochelin-binding protein, authentic frameshift  29.21 
 
 
330 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.74 
 
 
348 aa  136  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2627  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
301 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1007  iron-compound ABC transporter, iron-compound-binding protein  33.21 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00224248  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3079  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.41 
 
 
312 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3806  periplasmic binding protein  28.92 
 
 
297 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.17678 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0760  periplasmic binding protein  29.14 
 
 
342 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0777  periplasmic binding protein  29.14 
 
 
342 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0403  transferrin receptor  29.57 
 
 
347 aa  122  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.400692  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0661  periplasmic binding protein  29.45 
 
 
354 aa  119  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0949  transferrin receptor  30.8 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0298481  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1907  periplasmic binding protein  29.21 
 
 
350 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.217732  normal  0.206334 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  27.99 
 
 
662 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  27.95 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2424  periplasmic binding protein  35.2 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0634  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000010772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5226  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.31 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.08 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  26.58 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25350  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  26.69 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5247  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.31 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1770  periplasmic binding protein  24.36 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  27.24 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.63 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  26.97 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.83 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4795  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.28 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000034871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.39 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  26.04 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5234  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.91 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4953  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.47 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00660828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5197  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.91 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4815  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.91 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000198288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5330  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.47 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00008609  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  24.73 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.65 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.69 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.13 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2916  periplasmic binding protein  28.21 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.421383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.13 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  28.47 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  28.47 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2753  periplasmic binding protein  33.92 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.23 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.75 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.13 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.13 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  25.44 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  26.04 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  26.96 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  26.04 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  26.04 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  23.16 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  26.04 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.69 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.78 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  26.07 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  24.66 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001282  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  27.32 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1370  periplasmic binding protein  32.77 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0381194  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  26.97 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4918  periplasmic binding protein  28.22 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000189068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30540  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  26.3 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  24.23 
 
 
351 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0007  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.89 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>