More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1025 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  100 
 
 
348 aa  701    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  37.39 
 
 
315 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0777  periplasmic binding protein  33.51 
 
 
342 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0760  periplasmic binding protein  33.51 
 
 
342 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1354  enterochelin ABC transporter, periplasmic enterochelin-binding protein, authentic frameshift  34.32 
 
 
330 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0403  transferrin receptor  33.13 
 
 
347 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.400692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  29.57 
 
 
316 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  26.01 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  30.09 
 
 
321 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  27.27 
 
 
327 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  29.11 
 
 
339 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3666  periplasmic binding protein  29.31 
 
 
333 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3340  periplasmic binding protein  29.39 
 
 
339 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.002385  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3787  periplasmic binding protein  32.4 
 
 
314 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  30.27 
 
 
316 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  29.67 
 
 
316 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34400  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  30.45 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2404  periplasmic binding protein  28.84 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0899785  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0734  periplasmic binding protein  34.02 
 
 
348 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2366  periplasmic binding protein  31.78 
 
 
318 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.10704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  25.4 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3797  periplasmic binding protein  30.59 
 
 
309 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  30.2 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1005  periplasmic binding protein  27.71 
 
 
341 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1393  periplasmic binding protein  28.48 
 
 
340 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  28.86 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  28.86 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  28.86 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1007  iron-compound ABC transporter, iron-compound-binding protein  29.43 
 
 
342 aa  132  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00224248  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  29.47 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1111  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.01 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0675  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  30 
 
 
315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0949  transferrin receptor  28.77 
 
 
336 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0298481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2627  periplasmic binding protein  27.65 
 
 
301 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0661  periplasmic binding protein  28.27 
 
 
354 aa  123  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000332  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  28.52 
 
 
302 aa  122  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000938047  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  28.43 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5234  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.46 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4396  periplasmic binding protein  24.64 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1770  periplasmic binding protein  31.89 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5197  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.97 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4815  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.97 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000198288  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0300  periplasmic binding protein  26.47 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4795  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.68 
 
 
337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000034871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4953  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.39 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00660828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0007  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.6 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5226  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.68 
 
 
337 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5330  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.36 
 
 
333 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00008609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5247  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.39 
 
 
337 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4918  periplasmic binding protein  31.15 
 
 
337 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000189068  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3079  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.32 
 
 
312 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4264  transport system permease protein  25.84 
 
 
293 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1907  periplasmic binding protein  26.01 
 
 
350 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.217732  normal  0.206334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2916  periplasmic binding protein  28.07 
 
 
337 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.421383  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3806  periplasmic binding protein  25.08 
 
 
297 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.17678 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  27 
 
 
662 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  27.73 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  27.73 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3293  periplasmic binding protein  27.18 
 
 
288 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  27.22 
 
 
314 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0634  periplasmic binding protein  26.89 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000010772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  26.91 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  26.73 
 
 
314 aa  92.8  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2663  periplasmic binding protein  26.14 
 
 
340 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25350  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  27.4 
 
 
335 aa  92  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  26.61 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  26.61 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.61 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  26.61 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.61 
 
 
314 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  26.19 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.48 
 
 
331 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  26.5 
 
 
319 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30540  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  26.25 
 
 
335 aa  86.3  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0447  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.5 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0336  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  32.19 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000107153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0320  ferrichrome-binding periplasmic protein  32.19 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000029234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0383  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.19 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0323  ferrichrome-binding periplasmic protein  32.19 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000895612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0351  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  32.19 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0331  periplasmic binding protein  32.5 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0451  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.19 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0398  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  32.19 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4920  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  36.41 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.92 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.92 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.35 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  25.98 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  25.14 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0330  periplasmic binding protein  34.87 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000156949  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  26.9 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.94 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  26.9 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  30.83 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  22.94 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.07 
 
 
321 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.5 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.5 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>