56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3293 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3293  periplasmic binding protein  100 
 
 
288 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1770  periplasmic binding protein  39.93 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  31.05 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1354  enterochelin ABC transporter, periplasmic enterochelin-binding protein, authentic frameshift  25.56 
 
 
330 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  32.58 
 
 
316 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.53 
 
 
348 aa  99.4  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0734  periplasmic binding protein  26.92 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  30.04 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  29.14 
 
 
307 aa  88.2  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3666  periplasmic binding protein  26.39 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3340  periplasmic binding protein  26.14 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.002385  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0403  transferrin receptor  26.97 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.400692  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2366  periplasmic binding protein  28.47 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.10704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34400  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  27.54 
 
 
302 aa  79  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2404  periplasmic binding protein  27.21 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0899785  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1005  periplasmic binding protein  28.18 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  27.64 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  24.91 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  26.97 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1111  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.65 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3797  periplasmic binding protein  28.76 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3787  periplasmic binding protein  27.08 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0760  periplasmic binding protein  25.36 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0777  periplasmic binding protein  25.36 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  24.23 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3806  periplasmic binding protein  29.32 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.17678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  22.96 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4264  transport system permease protein  29.24 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1393  periplasmic binding protein  26.37 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0393092  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  25.76 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  26.53 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  25.76 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25.76 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3079  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.95 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  26.19 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0675  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  26.59 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4396  periplasmic binding protein  28.79 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0661  periplasmic binding protein  27.68 
 
 
354 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2627  periplasmic binding protein  27.09 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1007  iron-compound ABC transporter, iron-compound-binding protein  24.21 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00224248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0949  transferrin receptor  21.05 
 
 
336 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0298481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5226  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.33 
 
 
337 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5247  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.33 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4795  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.5 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000034871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4953  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.71 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00660828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5330  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  22.71 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00008609  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1907  periplasmic binding protein  23.61 
 
 
350 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.217732  normal  0.206334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2916  periplasmic binding protein  24.38 
 
 
337 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.421383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5197  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.27 
 
 
337 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5234  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.27 
 
 
338 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4815  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.27 
 
 
337 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000198288  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0300  periplasmic binding protein  25.09 
 
 
301 aa  46.2  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  21.74 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2663  periplasmic binding protein  23.85 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30540  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  27.31 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25350  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  25.42 
 
 
335 aa  42.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>